2003年10月，三亚市委召开书记办公会议专题研究文物保护管理工作问题，并做出了“要把崖城这座历史文化名镇保护利用好”的意见，拉开了该市崖城申报中国历史文化名镇的序幕。市政府每年都安排专门资金，对历史文物遗产进行保护，对重点文物单位进行修缮，其中03年崖城学宫一期维修工程126万元，主要是对学宫大成殿以及前东西庑进行修复；2005年，三亚市博物馆展览馆建设96万元，并邀请了省文博专家对该市第二批文保单位进行现场考察，听取了许多宝贵意见； 2006年，崖城学宫二期维修工程695万元（含国家文物局专项经费300万元等费用），并对司徒牌坊、泮池、状元桥、等进行了修复，修复工程和资金的投入使该市文物保护管理工作有了保障；2007年下半年，三亚市对学宫进行第三期维修，并编制《崖城历史文化遗产保护规划》，为上报崖城历史文遗产的保护提供了科学合理的依据。　　据了解，在组织申报第三批中国历史文化名镇的过程中，省建设局和省文体厅根据海南实际，把三亚市崖城镇排在首位。2006年8月，三亚市文体局向市政府递交了《关于崖城镇申报中国历史文化名镇的请示》，8月22日，市政府下文批准同意报送崖城镇第三批中国历史文化名镇，并成立了“三亚市中国历史文化名镇申报工作领导小组，为申报“中国历史文化名镇”做了大量宣传和前期铺垫工作。

　　2007年6月9日，三亚市崖城镇被国家建设部和国家文物局评为第三批“中国历史文化名镇”，在全国210个申报乡镇中共有41个乡镇入选，崖城镇排在第25位,是海南省唯一的“中国历史文化名镇”，一举填补了海南省的历史空白，为促进三亚旅游经济的发展和构造“文化三亚、和谐三亚”奠定了坚实基础。