截止2014年6月，连云港下辖3个市辖区、3个县级行政区：海州区、连云区、赣榆区、灌南县、东海县、灌云县，市人民政府驻海州区朝阳东路69号。
县区
面积
人口
政府驻地
下辖地区
海州区 727 110 新建东路 海州街道、幸福路街道、朐阳街道、洪门街道、新坝镇、锦屏镇、板浦镇、宁海街道、浦东街道、浦西街道、新东街道、新南街道、路南街道、新海街道、花果山街道、南城街道、云台街道、浦南镇；云台农场、南云台林场、岗埠农场
连云区
766
25
连云新城
墟沟街道、海州湾街道、连云街道、连岛街道、板桥街道、徐圩街道、朝阳街道、云山街道、宿城街道、高公岛街道、中云街道、猴嘴街道、东辛农场
赣榆区
1363
116
青口镇
青口镇、柘汪镇、石桥镇、金山镇、黑林镇、厉庄镇、海头镇、塔山镇、赣马镇、班庄镇、城头镇、城西镇、宋庄镇、沙河镇、墩尚镇
灌云县
1539
102
伊山镇
伊山镇、侍庄乡、东王集乡、图河乡、杨集镇、同兴镇、下车镇、南岗乡、四队镇、龙苴镇、圩丰镇、小伊乡、燕尾港镇
东海县
2041
115
牛山镇
牛山街道、白塔埠镇、黄川镇、石梁河镇、青湖镇、石榴街道、温泉镇、双店镇、桃林镇、洪庄镇、安峰镇、房山镇、平明镇、驼峰乡、李埝乡、山左口乡、石湖乡、曲阳乡、张湾乡、东海经济开发区
灌南县
1033
80
新安镇
新安镇、堆沟港镇、北陈集镇、张店镇、三口镇、孟兴庄镇、汤沟镇、百禄镇、田楼镇、李集乡、新集镇
人口单位：万人；面积单位：平方千米
除上述正式行政区外，连云港市还下辖6个城市功能区：新海新区、连云新城、徐圩新区（国家东中西合作示范区）、国家级经济技术开发区、国家级云台山风景名胜区。