2011年3月，锦州火车站外立面大修工程开始施工，施工单位是沈阳铁路局锦州房产生活段铁道建设有限公司，设计单位是锦州铁道勘察设计院。此项工程是根据原来楼的形状对其外观进行造型和设计，总体建设风格是欧式风格。
锦州站的候车室是1999年修建的，而售票室是1984年建造的。原来锦州站的候车室、售票室、出站口建设风格不统一，而且没在一个水平线上。此次改造后，锦州站大楼的外观统一设计，统一风格，采用干挂大理石和圆拱形玻璃幕墙材质设计。项目改造后，候车室的面积增加1000多平方米，把原来的沈阳客运段客运八队的办公室搬迁，将原来的候车室打通。另外，售票室增加一个卫生间。车站的外立面改造还结合室内的装修装饰。
2013年，准备进行高站台改造。锦州站一、二站台高站台改造工程，项目业主为沈阳铁路局。建设资金来自沈阳铁路局更改资金，项目出资比例为100%。招标人为沈阳铁路局辽西工程建设指挥部
建设规模： 锦州站一站台向东延长80米，改造后长490米，高1.25米；二站台向西延长28.9米，改造后长550米，高1.25米。将Ⅶ道和5道进行换边，并相应改造两端咽喉。在1、3道间增设渡线，并在3、5道间增设上水设施。优化平过道位置。挖填电缆沟3380延长米，敷设电缆8890米，安装电动转辙机22台，相应改造LKJ数据、CTC和CTC中心。