地层古生物学家。广东揭阳人。1908年10月7日（农历戊申年九月十三日）生于广东揭阳洋淇乡寨内村（今属揭东县登岗镇），于2009年9月17日在北京逝世，享年101岁。
曾就读于汕头市大中中学（现汕头市第四中学）[1] 。
1933年毕业于清华大学地质系，并留校任教。1935年考入清华大学中华教育文化基金资助的留美研究生。1936年进入美国耶鲁大学研究生院，在地质学家C．O．Dunbar教授的指导下习功地层学及古生物学．于1939年获理学博士学位，并以优异的成绩获美国Sigma Xi科学荣誉学会会员称号。同年回到祖国，先后任中山大学地质系教授、系主任，及两广地质调查所所长等职。1946年回清华大学地质系任教授。
1939年获美国耶鲁大学研究院哲学博士学位。中国地质大学教授。对无脊椎古生物的门类有深入研究，尤其是对腕足动物、软体动物、棘皮动物的研究造诣颇深。组织领导了对古生代与中生代之间生物绝灭事件的成因、二叠系与三叠系界线及其上下矿产形成规律的研究，并选择中国南方三个二叠－三叠系界线剖面作为国际候选层型，从而推动了这一研究的深入开展。1980年当选为中国科学院院士（学部委员）。
1952年全国高校院系调整，杨遵仪转任北京地质学院教授。先后担任地质学院的副总务长、专修科主任，水文系、石油系、普查系和地质系主任等职。曾任中国古生物学会副理事长，中国地质学会常务理事，中国地质学会地层古生物专业委员会主任，北京市地质学会副理事长，以及《中国科学》、《科学通报》、《地质学报》、《古生物学报》等专业学术期刊的主编、副主编或编委。还担任过国际地科联地层委员会冈瓦纳分会以及其他一些国际地质学术组织的负责人。1980年杨遵仪当选为中国科学院学部委员。1991年被评为北京市优秀教师，并被国家教委授予"全国优秀教师"称号。