仁寿周朝时系蜀国地，秦为蜀郡地，汉时分属犍为郡武阳县部分和蜀郡广都县部分，蜀汉时系犍为郡武阳县东境。南朝属怀仁郡所辖一县的怀仁县，治所在今文林桥附近。北朝西魏属陵州怀仁郡普宁县。隋开皇3年（公元583年）属罢郡后辖五县的陵州，名普宁县，为州治所在地。隋开皇18年（公元598年）改普宁为仁寿，县名沿用至今1400多年。北宋熙宁6年至民国14年（公元1073－1925）仁寿先后属成都府路、成都府、四川省政府管辖。1936年属四川省第二行政督察区（专员公署设资中）。
1949年12月16日仁寿解放，1950年1月1日成立县人民政府，属川南行政区内江专区。1958年改属乐山专区，境内汪洋区、回龙区11个公社划归威远。1 976年境内籍田区划归双流县。1985年乐山撤区建市，仁寿仍属乐山市管辖，1997年划归新建的由乐山市分出的眉山地区管辖，2000年眉山撤地建市，仁寿为眉山市辖县。
仁寿著名历史人物有被毛泽东主席评说为“伟哉虞公，千古一人”的南宋抗金名相虞允文，五代“花间派”词人孙光宪，近现代有爱国将领潘文华、董长安，有“东方梵高”之称的长安画派代表人物石鲁、著名画家冯建吴两兄弟，新中国地质事业奠基人之一的黄汲清院士。仁寿也是曾任中共政治局委员、全国政协副主席杨汝岱同志的家乡和他曾经长期工作过的地方。