1984年南通外贸出口几乎微不足道，90年代后出口扶摇直上，1984-1999年南通市年平均出口额为7.24亿美元，2000-2008年南通市年平均出口额为53.4亿美元，后9年南通市的年平均出口额为前14年的7.4倍。2008年南通市进出口总额达166.88亿美元，其中出口总额117.5亿美元。现出口贸易已扩展到全世界90多个国家和地区。出口商品结构基本实现了以初级产品出口为主到工业制成品出口为主的重大转变。一些资金技术含量高、附加值高的出口产品已形成一定生产规模，增强了南通出口产品参与国际市场的竞争能力，推动了南通产业结构和产品结构的升级优化。[52]
2012年，南通进出口总值263.0亿美元。[59] 2013年，南通全年进出口总值298.1亿美元，比2012年增长13.4%，其中，出口总值212.8亿美元，增长13.3%；进口总值85.4亿美元，增长13.6%。2013年末与南通市建立进出口贸易关系的国家和地区196个，全市有进出口业绩的企业4639家，增加6.5%。