七年秋冬，胤祥的身体已经非常不好了，雍正令太医院使刘声芳任户部侍郎，就是让他在胤祥身边为其随时诊疗病情。可胤祥还是亲自和高其倬一起翻山越岭，“往来审视”费尽辛苦，胤祥怕烦扰百姓“常至昏夜始进一餐”。这种身心俱疲的状态加重了他的病势。

八年正月初八，北运河青龙湾修筑减水坝，胤祥想要去现场勘察已不可能，只好奏请将此事交与侍郎何国宗（清朝数学家）督理监修。当时，怡亲王对其一同办理水利的下属说“本图遍治诸河，使盈缩操纵于吾掌之上，岂期一病沉废，已矣何言。”三个月后怡亲王就因病去世了，这番话听来让人不胜感慨，其事业心之旺盛、责任心之强可见一斑。八年二月先农坛的亲耕礼胤祥没有参加（此前他每年都参加）。八年三月雍正连下两道圣旨，让别人代理营田和传教士事务。胤祥病后，雍正对他“医祷备至”，他为了宽慰雍正，“旬月间必力疾入见”。

雍正八年（1730）五月初四日，胤祥病故，年仅四十四岁。雍正悲痛万分，在八年九月初六的上谕中曾说：“朕因忆吾弟怡贤亲王在日，八年以来诚心协赞，代朕处理之处不可悉数。从前与吾弟闲谈中，每常奏云，圣躬关系宗社至为重大，凡臣工可以办理者皆当竭诚宣力以代圣躬之劳，臣心实愿将己之年龄进献，以增圣寿。彼时闻之，深为不悦，以此言为非。今日回思吾弟八年之中辅弼劻襄，夙夜匪懈，未必不因劳心殚力之故伤损精神以致享年不久。且即以人事论之，吾弟费八年之心血而朕得省八年之心血，此即默默中以弟之寿算增益于朕躬矣”。