寿宁县地处鹫峰山脉北端，洞宫山脉东麓。地势从西北向东南倾斜。西北部中山山地，最高峰山羊尖海拔1649米；东南部中低山地，海拔400米～800米的山地多深谷，800米左右地带镶嵌着山间盆地；西南部沿斜滩溪、平溪分布着河谷台地。主要河流有交溪上源的斜滩溪，境内长56.5千米、流域449.9平方千米，支流有长溪、九岭溪、十八曲；后溪，境内长48千米，流域257.5平方千米，支流有犀溪； 还有蟾溪。人工湖有麻竹坪、小托水库。年平均气温15.1℃；1月平均气温4.7℃，7月平均气温22.6℃；极端最高气温35.8℃，极端最低气温－9.8℃；≥10℃的积温4249℃。年降水量2472毫米，无霜期235天。

境内耕地1.06万公顷，有林地13.10万公顷，林木蓄积量196.5万立方米，毛竹619.4万根，森林覆盖率69.4％。草山、草坡地1.47万公顷，天然植被物种丰富，有水杉、银杏、三尖杉、油杉等珍稀树种。水力资源理论蕴藏量27.65万千瓦，可开发21万千瓦，为全国农村初级电气化达标县之一。矿藏有磁铁、铁砂、白云石、叶蜡石、石英石、明矾、金、银、钨、锰、高岭土、泥炭、花岗石、紫砂陶土。