2008年9月26日，中国科学院与上海市人民政府签订《进一步深化院市合作协议书》，决定合作建设中科院 上海科技大学

上海浦东科技园暨中科院上海高等研究院，充分利用双方的资源和优势，共同建设一所高水平的研究型大学。

2010年12月26日，中国科学院上海高等研究院（筹）正式入驻中国科学院上海浦东科技园。

2012年4月28日，教育部批准筹建上海科技大学。

2012年10月12日，上海科技大学免疫化学研究所揭牌成立，Richard .A Lerner教授担任首任所长。

2012年10月29日，上海科技大学与加州大学伯克利分校签署合作备忘录，双方协定在今后五年开展教育、文化与科研合作。

2012年11月12日，诺贝尔奖获得者Roger D. Kornberg受聘上海科技大学免疫化学研究所教授。

2012年11月20日，上海科技大学iHuman研究所揭牌成立，Raymond C.Stevens教授担任首任所长。

2012年12月9日至13日，上海科技大学成功举办2012年国际前沿信息科学技术研讨会。

2012年12月28日，上海科技大学校园建设正式启动，标志着上海科技大学筹建工作进入了实质性阶段。

2013年9月3日，上海科技大学首届研究生开学典礼在中科院

科技园举行。

2014年2月，上海科技大学宣布将招收首届200名本科生。

2014年3月起，上海科技大学开展第一届本科生校园开放日活动。

2014年9月，上海科技大学第一届本科生、第二届硕士研究生入学。