秦淮河是南京古老文明的摇篮，南京的母亲河，历史上极富盛名。这里素为“六朝烟月之区，金粉荟萃之所”，更兼十代繁华之地，“衣冠文物，盛于江南；文采风流，甲于海内”，被称为“中国第一历史文化名河”。

远在石器时代，流域内就有人类活动。从东水关至西水关的沿河两岸，东吴以来一直是繁华的商业区的居民地。六朝时成为名门望族聚居之地，商贾云集，文人荟萃，儒学鼎盛。宋代开始成为江南文化的中心。

明清两代，尤其是明代，是十里秦淮的鼎盛时期。明末清初，秦淮八艳的事迹更是脍炙人口。

秦淮河古称龙藏浦，后称淮水，秦淮河大部分在南京市境内，是南京主城最大的地区性河流，其中流经南京城内的一段被称为“十里秦淮”。

秦淮河有南北两源，北源句容河发源于句容市宝华山南麓，南源溧水河发源于南京市溧水区东庐山，两河在南京市江宁区方山埭西北村汇合成秦淮河干流，绕过方山向西北至外城城门上坊门从东水关流入南京城，由东向西横贯市区，南部从西水关流出，注入长江。

秦淮河两岸共有16条支流河道汇入，其中人工开挖河道2条，即秦淮新河和天生桥河。秦淮河在南京城东南通济门外九龙桥处分为内、外两支。

秦淮河在南京城内曾有几条支流，主要是青溪、运渎、潮沟等等，这几条河都经过人工开凿并且相互沟通，形成了古代南京城内的水道网，后因历代筑城、修建，大豆被壅断、预赛，只剩下断续的残存河段。

内秦淮过九龙桥直向西，由东水关进入南京城，向西流至淮清桥与青溪会合，再向西南在利涉桥汇小运河，再经文德桥、武定桥、镇淮桥转折向西北，过新桥至上浮桥、陡门桥，与运渎水会合，再过下浮桥，向西经过夫子庙，从西水关出城。内秦淮全长10公里，在南京城中，是最繁华之地，被称为“十里秦淮”。

外秦淮在南京城南外绕行，是五代十国时开凿的护城河，过九龙桥向南转折向西，经长干桥后汇合落马涧，向西至赛虹桥、觅渡桥在西水关外与内秦淮复合，合流后向北经草场门、定淮门、石头城，经三汊河汇入长江。外秦淮在在合流前在赛虹桥分出支流，过江东桥，在北河口入江。秦淮河在三汊河入江以前分出支流惠民河，向东北经中山桥，至下关入江。

秦淮新河位于江宁东山与长江之间，全场17千米，是1981年建成的人工河道，经西善桥到金胜村入江，河口设节制闸和抽水站。

秦淮东河开挖于2011年，秦淮河的入江通道，用来解决外秦淮河行洪不足的问题，秦淮东河工程分洪流量约300立方米/秒，河道全长约33公里，其中新开河道8公里、穿山5公里、拓宽河道20公里，河口宽95—105米。秦淮东河打通东部的运粮河、九乡河和七乡河，形成一条东部的新水系。从秦淮河干流上坊门桥附近开始，拓浚秦淮河支流运粮河，穿秦淮河与九乡河之间的分水岭，大致沿京沪高铁和绕越公路至九乡河，再穿九乡河与七乡河的分水岭，最终连通七乡河，拓浚七乡河入江。

秦淮河是长江下游的一条支流，从北源至三汊河全长110千米，全流域面积2630平方千米，干河长36.61千米，秦淮新河长16.84千米，内外秦淮河合流之后的武定门闸处的多年平均流量为15立方米每秒。[3] 流域气候：温暖湿润，雨量充沛，多年平均降水量1036.7mm，多年平均地表径流量10.1亿m3，多年平均径流系数为0.32。

水资源量：流域水资源量主要由降水补给，其在时空上的变化与境内降水的年内分配、年际变化和地区分布基本吻合。径流量年内分配不均，流域汛期（5-9月）径流量约占全年的60-70%左右，12月份地表径流量很小，很多支流出现断流现象。年际变化大，丰水年（P=20%）的径流量（14.89亿m3）为特枯年（P=95%）的（4.69亿m3）的3.2倍。

主要站点水位：

东山水位站，历年最高10.74米，发生在1991年，最低水位3.79米，发生在1951年。2010年最高水位9.71米，发生在7月17日。2010年最低水位6.67米，发生在4月17日。年平均水位1.57米。警戒水位8.50米。

武定门闸上游，历年最高10.36米，发生在1991年，最低水位河干，发生在1969年。2010年最高水位9.52米，发生在7月13日。2010年最低水位6.60米，发生在3月31日。

武定门闸下游，历年最高10.36米，发生在1991年，最低水位河干，发生在1969年。2010年最高水位9.52米，发生在7月13日。2010年最低水位4.58米，发生在4月2日。历年最大流量 509m3/s， 发生在1974年。