据《台山县华侨志》记载，马超俊是白沙镇上南朗猪头咀村人，１７岁赴美深造，肄业于旧金山庇鲁机器专门学校。

在美国期间，马超俊适逢孙中山到旧金山宣传革命，得致公堂黄三德介绍，他认识了孙中山并加入同盟会，献身革命。１９０５年，马超俊离美往日本，就读于明治大学，后来奉孙中山之命回国策动革命，入汉阳兵工厂，随后又转入上海制造局当技工，宣传革命真理，组织工人参加革命。粤、汉等各地劳工深受其影响，纷纷组织工会，响应革命，贡献良多。１９０７年１２月，马超俊参加镇南关之役，失败后，开办了“中兴公司”，掩护革命党人，联络集会秘密活动。１９１１年１０月武昌起义，他率领海员１００余人，组织广东华侨敢死队，由沪赴汉，转战汉口大智门，继而坚守汉阳兵工厂，与清军冯国璋部苦战８日８夜，弹尽援绝，才率残部撤回武昌。

民国初建，马超俊任国会议员，黎元洪委任其汉冶矿务督办以笼络，马超俊知其意而坚辞不就。之后，袁世凯称帝阴谋败露，他乃复回汉口，参加“铁血团”组织，被捕入狱８个月，孙中山托伍廷芳、温宗尧从中活动，马超俊终于获释。１９１４年，马超俊受命到广州设立海鸥针织厂，秘密进行倒袁运动，同时组织“暗杀队”。“二次革命”失败后，马超俊避到日本，孙中山遣送其入琴瑟湖八日市中华革命党航空学校学习飞行，历时２年。１９１６年，马超俊随中华革命军东北总司令居正领导之航空回国参加讨袁之役，是年４月率机队轰炸济南山东访府署，６月６日袁世凯在全国人民的愤怒声讨中死去，反袁运动结束，马超俊转赴北平筹设民间航空学校，为创办航空学校募集资金。１９１７年６月，孙中山电召马超俊南下，参加“护法运动”，从此离开航空界。

１９１７年，马超俊受命拟订“开展全国劳工运动计划”，是年底“全国机器工人联合会”于广州成立。１９２０年，孙科任广州市市长，马超俊担任广州市府特别助理，继任广州市政府委员。

在中国劳工运动史中，马超俊参与策动的有：１９１９年广州机器工人罢工，１９２０年香港机器工人大罢工和１９２２年香港海员大罢工，均取得重大的胜利。陈炯明叛变后，马超俊组织发动工人罢工，陈炯明下令悬赏１０万元逮捕马超俊，马超俊遂离粤奉命组织游击队讨陈，１９２３年１月率部参加光复广州之役，４月任广东石井兵工厂副厂长，后因护厂有功升为厂长。在任期内，曾秘运枪械５００支给黄埔军校武装学生军。１９２６年，马超俊奉派南北美洲考察工人运动，并联络海外华侨吸收参加革命工作，１９２７年归国，任国民政府劳工局长兼“劳工立法起草委员会”主任委员。１９２８年任国民党广东省党部整理委员、广州特别市党部执行委员长兼宣传部长、广东省政府委员、农工厂厅长、建设厅长等职。１９２９年任广州市党部执行委员，国民党第三届中央候补执委，同年出席日内瓦国际劳工大会，担任劳方代表。

１９３１年５月１日，马超俊膺任欧美各国劳工考察专员，１１月任南京市市长。１９３５年任国府委员，１９３７年复任南京市市长。１９３８年任中国战时儿童救济会副会长、全国慰劳总会副会长、国民党中央社会部副部长。１９４０年任国民党组织部副部长。１９４５年抗战胜利，马超俊第三次出任南京市市长，１９４６年１２月调任中央农工部长，领导各省、市总工会，及全国性铁、工、邮、盐、矿各业复恢组建工会，综合成立全国总工会，同年当选国民党中央执行委员会常务委员，国民党代表大会代表。１９４９年马超俊去台湾，１９６９年８月４日患脑血管栓塞症，长期卧病医院，于１９７７年９月１９日在台湾荣民总医院病逝，享年９２岁，葬于台北近郊金山富贵墓园。