六榕六榕
（989）重修后，铸造禅宗六祖惠能(638-731年)铜像供奉，因寺僧主修净业，遂改名为净慧寺。宋代文学家、书法家苏轼于宋元符三年（1100）路经广州时，游静慧寺，览舍利塔，僧人请他为寺庙题字，东坡看到寺院有六棵榕树，遂挥笔写了“六榕”二字，寺庙门口的“六榕”就是苏东坡的手迹。大门对联"一塔有碑留博士，六榕无树记东坡"，即指此事。其中的"博士"指王勃；如今六株榕树已不存在，因为东坡而令人追忆。宋元佑元年(1036年)，德超和尚驻锡此寺，名僧道琮和尚、南海郡人前任凤翔府宝鸡县主簿林修以及信士王衢等众檀越，共议重建宝塔。绍圣四年(1097年)六月三日，新塔落成，塔壁佛龛供奉贤劫千佛等圣像，自此称千佛塔。
清初，“环寺驻防”之清兵目睹千佛塔色彩斑斓，以其远东习俗称呼曰“花塔”，故净慧寺亦名“花塔庙”。民国重修时，“为通俗计”，在公函、募捐告示和《碑记》中悉称“花塔”，于是成为正式命名沿用至今。
清代

清光绪元年(1875年)，继咸、同年间修建殿宇之后，重修千佛塔亦告竣工，此时撰《重修六榕寺佛塔记》，净慧寺始正式易名为六榕寺。1931年重修时在内部用钢筋水泥加固。
1979年3月，中共广州市委批准六榕寺恢复为宗教活动场所。1983年，在塔之西重建大雄宝殿，供奉清康熙二年(公元1663年)以黄铜精铸的三尊大佛像。六榕寺在云峰法师及众大德师僧、四众弟子努力下，重新修复。六榕寺大放光彩，十分庄严，接待了海内外游客和文人禅客。法量法师如法律仪，领众清修。著名学者、文学家、哲学家方海权为六榕寺作诗《六榕咏》曰：
淡结荷香韵六榕，
雕栏塔立俏如峰。
沉凝万代禅风定，
八面玲珑入满容。