1988年4月1日，撤销日照市日照镇、岚山头镇，分别以原镇的行政区域设立日照、岚山头2个街道办事处。

1992年12月19日，设立日照市前三岛乡，隶属日照市东港区，辖平岛、达山岛、车牛山岛。

1995年11月30日，撤销东港区丝山乡，设立秦楼街道办事处。

1996年5月24日，撤销东港区河山乡、西湖乡，设立河山镇、西湖镇（鲁政函民字[1996]25号）。

2000年，东港区辖5个街道、13个镇、5个乡：日照街道、石臼街道、奎山街道、秦楼街道、岚山头街道、汾水镇、碑廓镇、西湖镇、河山镇、三庄镇、巨峰镇、后村镇、两城镇、陈疃镇、南湖镇、高兴镇、涛雒镇、黄墩镇、大坡乡、尹家河乡、竖旗山乡、虎山乡、前三岛乡。　根据第五次人口普查数据：1148190人，各乡镇人口： 日照街道 178166、石臼街道 77223、奎山街道 41484、秦楼街道 80572、岚山头街道 40540、河山镇 30717、两城镇 41110、涛雒镇 65272、高兴镇 33098、巨峰镇 44926、后村镇 56452、西湖镇 33963、陈疃镇 28511、南湖镇 45810、三庄镇 39967、黄墩镇 49897、汾水镇 39057、碑廓镇 47122、大坡乡 28247、竖旗山乡 24135、尹家河乡 19610、虎山乡 54558、前三岛乡 4823、日照开发区虚拟街道 42930。

2000年12月27日，东港区撤销竖旗山乡，将其行政区域并入三庄镇；撤销尹家河乡，将其行政区域并入南湖镇；撤销大坡乡，将其行政区域并入巨峰镇；撤销汾水镇，以原汾水镇的行政区域设立安东卫街道办事处，办事处机关驻原汾水镇人民政府驻地（鲁政函民字[2000]87号）。

截至2002年12月31日，东港区辖6个街道、13个镇、1个乡。

2004年9月9日国务院批准（国函[2004]71号）：将东港区的岚山头、安东卫2个街道和虎山、碑廓、黄墩、后村、高兴、巨峰6个镇划归岚山区管辖。行政区划调整前，东港区面积1915平方千米，人口117万（面积人口数据根据简册2004）。

2012年7月3日，后村镇重新划归东港区管辖。

乡镇简介

石臼街道：地处山东半岛南翼的日照新市区境内，东波濒黄海，是日照的海隅要塞，对外开放的窗口和新亚欧大陆桥东方桥头堡的前沿。现辖16个居委和2个社区，辖区面积13.5平方千米，区域人口5.95万，流动人口1.9万，是日照市第一个纯城市性质的街道。石臼建村于宋代以前，考石臼之称，一传自宋代始，有漂泊海洋的渔家在东南隅岬角驻足拴缆，上岸舂米为食，形成多处臼状石坑，故称“石臼”。历代建置变迁，有“石臼所口”、“石臼里”、“石臼社”、“石臼所”等称谓，1985年由石臼镇改置石臼办事处，1998年改名石臼街道至今。

前三岛乡：设立于1992年，辖前三岛和王家海屋、刘家海屋、代家庄子、秦家官庄四个村居，总面积2.12平方千米，人口2842人。2005年由岚山区管辖。