新垦镇位于东经113. 35°，北纬22. 36°,为广州市番禺区的最南端、珠江出海口前沿，濒临伶汀洋，三面环海，北连万顷沙、距市桥城区50公里；西临洪奇沥河口，东南和西南约28海里分别和香港、澳门隔海相望。交通方面：从新垦镇沿灵新公路向北约13公里可到达广珠东线公路的二涌路口，再向北约6公里到达京珠高速公路的庙贝出入口；水路方面，向东北约15公里就是南沙港，本镇的渔港码头有二个5000吨的泊位可供各种船只停泊。

新垦镇属亚热带海洋季风气侯，冬无严寒，夏无酷暑，雨量充沛，光照充足。全年平均气温21.8℃，1月份平均气温13.2℃，7月平均气温29℃，绝对最高温度37℃，最低温度－0.1℃，年≥10℃的活动积温7600℃，无霜期346天；年平均降雨量1635毫米，年平均湿度在80%以上；年平均风速2.5米/秒，日照时间为1930小时。由于地处珠江入海口咸、淡水交界处，每年11月至翌年的2月份为半咸水期，咸度约为1－8‰，其余为淡水期 。

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