南沙群岛主权历代以来都属于中国，并一直为中国渔民所使用，一些大的岛上都有中国渔民建的庙和打的水井等。1933年法国的入侵才开始引起主权争议。中国(包括中国台湾)与越南两方均声称拥有该群岛完整的主权，马来西亚、菲律宾则宣称拥有部分岛屿的主权，并且派军队进占相关岛礁，文莱与印度尼西亚则是宣称拥有此区海域的主权，进而间接包含了南沙群岛部分区域 。

中国古代政府对西沙群岛的管理始于秦代。公元前221年，秦始皇统一六国后，分全国为42郡，其中南海郡管辖包括西沙群岛在内的整个南海诸岛。公元前111年，汉武帝平定南粤之乱后，在海南岛设儋耳、朱崖两郡，辖南海诸岛，并派水师巡视西沙。东汉杨孚《异物志》有"涨海崎头，水浅而多磁石"的记载。这里的"涨海"是当时中国人民对南海的称呼，"崎头"则是当时对包括西沙群岛和南沙群岛在内的南海诸岛的岛、礁、沙、滩的称呼。 三国东吴将领康泰所著《扶南传》不仅提到了南沙群岛，而且对其形态描述道："涨海中，到珊瑚洲，洲底有盘古，珊瑚生其上也。" 南朝时，朝廷仍派出舟师巡视南海。《旧唐书·地理志》记载，振州（今海南三亚）疆域“西南至大海千里”，西沙群岛包括在内。唐宋年间，许多历史地理著作将西沙和南沙群岛相继命名为"九乳螺洲"、"石塘"、"长沙"、"千里石塘"、"千里长沙"、"万里石塘"、"万里长沙"等。宋元明清四代，以"石塘"、"长沙"为名记述南海诸岛的书籍多达上百种。唐穆宗时明令岭南节度使管辖的范围包括南海诸岛。《琼州府志》记载，宋仁宗庆历（1041－1048）年间，将西沙群岛列为广南水军的巡海范围之内。 元代，对南海诸岛地理位置的记载更为详细。汪大渊所著《岛夷志略》中有"万里石塘，由潮洲而生，迤逦如长蛇，横亘海中......原其地脉。历历可考。一脉至爪哇，一脉至渤泥及古里地闷，一脉至西洋遐昆仑之地"。其中"万里石塘"指包括今南沙在内的南海诸岛。 明代《混一疆理历代国都之图》中标有石塘、长沙和石塘。从图中标绘的位置看，后一个石塘是今南沙群岛。 清代《更路簿》记载了中国海南岛渔民所习用的南沙群岛各个岛、礁、滩、洲的地名具体方位，其中南沙计73个地名。

中国人民至迟明初就到南沙群岛从事开发渔业生产。早在明代，有海口港、铺前港和清澜港渔民及文昌县渔民到南沙群岛去捕捞海参等物。

1868年《中国海指南》记载了我国渔民在南沙群岛活动情况，郑和群礁有"海南渔民，以捕取海参，贝壳为活，各岛都有其足迹，亦有久居礁间者，海南每岁有小船驶往岛上。携米粮及其他必需品，与渔民交换参贝。船于每年十二月或一月离海南，至第一次西南风起时返。"清末以来，我国海南岛和雷州半岛各地渔民都有人到南沙群岛去捕鱼，其中以文昌、琼海两县最多，每年仅从此二地去的渔船就各有十几条到二十多条。

《更路簿》是中国人民明清以来开发南海诸岛的又一有力证明。它是中国海南岛渔民在西沙和南沙群岛进行生产活动的航海指南，积累了许多人航行实践经验的集体创作，它孕育于明代，后不断完善，记载了渔民从海南岛文昌县的清澜或琼海县的潭门港起，航行至西沙、南沙群岛各岛礁的航海航向和航程。

民国以来我国渔民开发经营南沙群岛的史实，中外史料均有记载。日本小仓卯之助《暴风之岛》记载1918年他组织的探险队到达北子岛时发现三位"文昌县海口人"。1933年日本三好和松尾到南沙调查时看到北子岛有中国人2名、南子岛有中国人3名住在那里。日本《新南群岛概况》记载，中业岛有渔民"栽种之甘薯"，"昔时有中华民国渔民居住于此岛，并种植椰子、木瓜、蕃薯和蔬菜等"。

3、中国最早对南沙群岛行使管辖

从秦代开始，我国政府正式对西沙群岛行使管辖权。汉代，南沙群岛已归我国管辖。唐、宋、元、明、清，南海诸岛一直归我国政府管辖。到了元代，我国人民已经大规模开发包括南沙群岛在内的整个南海诸岛了。《元史》地理志和《元代疆域图叙》记载元代疆域包括了南沙群岛。其中《元史》记载了元朝海军巡辖了南沙群岛。《元史》记载，至元十六年（1279年），元世祖忽必烈委派同知太史院士郭守敬到南海进行测量，在绘制的《广舆图》中，把南海诸岛的西沙群岛标为“千里长沙”，南沙群岛标为“万里石塘”。

明代《海南卫指挥佥事柴公墓志铬》记载："广东濒大海，海外诸国皆内属"，"公统兵万余，巨舰五十艘"，巡逻"海道几万里"。表明南沙群岛属于明代版图，明代海南卫巡辖了西沙、中沙和南沙群岛。

在清代，中国政府将南沙群岛标绘在权威性地图上，对南沙群岛行使行政管辖。1724年的《清直省分图》之《天下总舆图》、1755年《皇清各直省分图》之《天下总舆图》、1767年《大清万年一统天下全图》、1810年《大清万年一统地量全图》和1817年《大清一统天下全图》等许多地图均将南沙群岛列入中国版图。 1932年和1935年，中国参谋本部、内政部、外交部、海军部、教育部和蒙藏委员会共同组成水陆地图审查委员会,专门审定了中国南海各岛屿名称共132个，分属西沙、中沙、东沙和南沙群岛管辖。

1933年，法国侵占我国南沙群岛的太平、中业等九个岛屿，立即遭到我在南沙群岛生活和从事生产活动的渔民强烈反抗，中国政府也向法国政府提出抗议。 1935年，中国政府的水陆地图审查委员会编印《中国南海各岛屿图》详细标明包括南沙群岛在内的南海诸岛各岛礁的具体名称。

1939年，日本侵占了南海诸岛。第二次世界大战期间，日本发动侵华战争，占领了中国大部分地区，包括南沙群岛。《开罗宣言》和《波茨坦公告》及其他国际文件明确规定把被日本窃取的中国领土归还中国，这自然包括了南沙群岛。日本投降后，时任国民党海军海防第二舰队司令的林遵率“太平”、“中业”两舰接收南沙群岛，将南沙主岛以所乘军舰舰名改为“太平岛”，并在岛上树立刻有“太平岛”字样的纪念碑。随后接收人员又到中业岛、西月岛、南威岛，分别在岛上举行接收仪式，并立碑为证。

1946年12月，当时的中国政府指派高级官员赴南沙群岛接收，在岛上举行接收仪式，并立碑纪念，派兵驻守。1947年，中国内政部重新命名包括南沙群岛在内的南海诸岛全部岛礁沙滩名称共159个，并公布施行。公布11段海洋断续国界线。

日本政府于1952年正式表示"放弃对台湾、澎湖列岛以及南沙群岛、西沙群岛之一切权利、权利名义与要求"，从而将南沙群岛正式交还给中国。对于这一段历史经纬。各国都是十分清楚的。事实上，在此后的一系列国际会议和国际实践中，美国一直承认中国对南沙群岛的主权。

战后相当长时期内，并不存在所谓的南海问题。南海周边的地区也没有任何国家对中国在南沙群岛及其附近海域行使主权提出过异议。

越南在1975年以前明确承认中国对南沙群岛的领土主权。菲律宾和马来西亚等国在70年代以前没有任何法律文件或领导人讲话提及本国领土范围包括南沙群岛。美国与西班牙1898年签订的巴黎条约和1900年签订的华盛顿条约曾明确规定了菲律宾的领土范围，但并未包括南沙群岛。1953年菲律宾宪法、1951年菲美军事同盟条约等也对此作了进一步确认，而马来西亚只是到了1978年12月，才在其公布的大陆架地图上将南沙群岛的部分岛礁和海域标在马来西亚境内。

不少国家政府和国际会议的决议也承认南沙群岛是中国的领土。例如，1955年在马尼拉召开的国际民航组织太平洋地区航空会议通过的第24号决议，要求中国台湾当局在南沙群岛加强气象观测，会上没有任何一个代表对此提出异议或保留。许多国家出版的地图也都标注南沙群岛属于中国。例如，日本1952年由外务大臣冈崎胜男亲笔推荐的《标准世界地图集》，以及1962年由外务大臣大平正芳推荐出版的《世界新地图集》，1954年德意志联邦共和国出版的《世界大地图集》，1956年英国出版的《企鹅世界地图集》，1956年法国出版的《拉鲁斯世界与政治经济地图集》等都明确标注南沙群岛属于中国。越南1960年、1972年出版的世界地图及1974年出版的教科书都承认南沙群岛是中国领土。二十世纪以来，许多国家权威性百科全书，如1963年美国出版的《威尔德麦克各国百科全书》，1973年的《苏联大百科全书》和1979年日本共同社出版的《世界年鉴》都承认南沙群岛是中国领土。

70年代开始，越、菲、马等国以军事手段占领南沙群岛部分岛礁，在南沙群岛附近海域进行大规模的资源开发活动并提出主权要求。对此中国政府一再严正声明，这些行为是对中国领土主权的严重侵犯，是非法的、无效的。这些国家的所谓法律依据是根本站不住脚的。

1983年，中国地名委员会授权公布包括南沙群岛在内的南海诸岛标准地名。