启东市科技局负责贯彻执行党和国家有关科技工作、知识产权工作、组织制订全市科技发展、科技体制改革和科技促进经济、组织科技创新工作，促进启动市的科技发展。

贯彻执行党和国家有关科技工作、知识产权工作、防震减灾工作的方针、政策、法律、法规，并结合本市实际，组织制订全市科技发展、科技体制改革和科技促进经济、社会发展的战略、方针、政策，研究确定全市科技发展的重大布局和优先领域，推动全社会的科技进步。

组织编制和指导实施全市科技发展、知识产权、防震减灾中、长期规划和年度计划；负责全市科技统计监测和技术创新能力评价工作，牵头组织全市科技进步目标责任制的考核工作。
会同有关部门综合运用财政、金融、税收等经济手段，多渠道增加对科技的投入；负责归口管理科技三项费用、科学事业费、科技支撑项目及重点实验室经费、科技基金及高新技术成果转化风险投资等专项资金。
负责全市科技创新体系建设，引导、支持、帮助企业建设科技开发与成果转化机构；管理社会化科技中介服务机构，培育加速成果转化的服务体系；管理和引导咨询业的发展，承办科技咨询机构的信誉等级申报工作。
承担市政府与重点高等院校、科研机构科技合作的相关工作，组织项目的引进、消化、吸收、转化，扩大项目源，提高科技对经济和社会发展的支撑力度。