据考证，早在3.5万年前，准旗境内就已有了以渔猎和采集为主要生活手段的古人类活动，其文化面貌与鄂尔多斯

"河套人"及"萨拉乌苏文化"有相连之处；夏商周时期（公元前21世纪至公元前4世纪），旗境为荤粥、土方、鬼方、猃狁、林胡和白狄等部族的驻牧地，这些游牧部落同当时的中原王朝分庭抗争，时有攻伐征讨；战国时期，魏、秦、赵等诸侯势力曾先后进入今准格尔旗地区，自此开始了历史上汉族和北方少数民族聚居的文化交融。 清顺治六年（1649年），清政府仿满洲八旗编制，将鄂尔多斯部落划分为六旗，准格尔旗当时称鄂尔多斯左翼前旗，并在今旗境东南部划出宽25公里，长110公里的地段为"禁留地" ，作为皇家牧场。清朝末年，中国沦为半殖民地半封建社会，清政府为摆脱经济困境，推行"移民实边,开放蒙荒"政策以大量搜刮押荒银，致使大片森林、牧场遭到破坏，造成大片土地沙化和严重的水土流失。从此准格尔旗地区的生态环境开始恶化，气候变得寒冷干燥。中华民国时期，按照"优待蒙古条例" ，内蒙古仍袭清制，准旗建置如前。1948年5月，准格尔旗解放，旗府设于沙圪堵镇。1950年1月，末代王爷奇福海回沙圪堵交印，同年，准格尔旗人民政府成立，结束了封建王公在准旗的统治。