准格尔召镇政府住持喇嘛每年农历4月举办玛尼会，7月举办雅尼会。届时商贾云集，铺面罗列。农牧民远道而来，赶会并参加物资交流活动，人数往往高达三、五万人之多，是鄂尔多斯地区仅次于成吉思汗陵祭祀活动的又一大宗教盛会，为整个佛教界所瞩目。

玛尼会准格尔召在农历四月廿三日至廿五日举办玛尼会。届时，远近各地喇嘛来此诵经，祈祷人们能吉祥如意、工作顺利、身体安康。相传，过去蒙古族老人死后经喇嘛诵经可上天堂，后来演变为诵经可为人们祈求祝福。庙会上由喇嘛亲手制作而成的玛尼饼，久存不变质，味道独特。每个玛尼饼的原料、大小、轻重都是一样的。

雅尼会 准格尔召农历七月初七至初九举办雅尼会，要进行“跳鬼”等一系列宗教活动，并邀请山西晋剧团前来表演助兴，也是准格尔召一年一度的物资交流大会。