南京总统府已有600多年的历史，1840年鸦片战争至1949年人民解放军占领南京的100多年里。这里多次成为中国政治军事的中枢、重大事件的策源地，中国一系列重大事件或在这里发生或与这里密切相关，一些重要人物都在此活动过。南京解放后的近50年中，总统府一直作为机关的办公场所。目前，博物馆总占地面积为9万平方米，共分三个参观区域。

总统府坐落在南京市长江路292号。东边是一座中西合璧的大型建筑群西边是一座极为精致的江南园林称西花园。这里原是600多年前来元璋招降陈理后为其建造的汉王府。明永乐初年朱高煦被封为汉王再次在此建造王府今汉府街地名即由此而来因之花园又称“煦园”。清代为两江总督署太平天国攻占金陵后把这里做为天朝宫殿。1912年元旦孙中山在这里就任临时大总统后孙中山就将此作为总统办公室和会议室。西花园东北侧的一座中式楼房后称“中山堂”是孙中山先生的卧室、餐室和浴室楼下是警卫人员的住房。

国民党统治时期天朝宫殿一度成为蒋介石的办公处末期改为总统府。在后面建造了一座子超楼蒋介石在二楼119房间办公副总统李宗仁在对面118房间办公三楼会议厅是当时举行国务会议的所在。

总统府大门是西洋古典式大门内两侧数十米长的朝房是卫士的驻地。二门为中国古代衙门式大堂几十根粗大的红柱立于其间气势不凡。其后是一条很长的走廊走廊两侧有礼堂、外宾接待室、总统休息厅及参事处、文官处等中西建筑最后面是以国民政府主席林森的号命名的5层现代西式建筑―――“子超楼”。蒋介石和李宗仁都曾在子超楼的二楼办过公。整个府邸建筑包括正宅、厅、楼、亭、阁等共1189间。各建筑是均有走廊相通雨天无需打伞即可走到每座建筑。

从西侧朝房尽头向西拐进一月洞门就是西花园一进园门迎面是一座中空的假山假山上是座两层的六角亭上层耸于山巅下层掩在石中。西北侧还有一座方胜亭此亭像是两个方亭重合一半造型独特较为罕见。东边是三开间的桐音馆建于1870年是曾国藩的花厅。它飞檐、翘角、圆顶四面皆窗。门前屋后有高大的梧桐数株每逢下雨雨点打在梧桐叶上叮咚作响饶有趣味故称桐音馆。

西面是一个形似花瓶的水域称太平湖。它南北长而东西窄为弥补此自然不足设计者别具匠心地将南北两个建筑建于水中。南边是一石舫竖直泊于水中有曲折石桥可登。舫以青石砌成造型精巧舱内陈设着根雕式桌椅。当年乾隆旁南巡时曾亲赐匾额“不系舟”。每当微风轻拂波随风动。舫若徐行。从西侧登岸向北是夕佳楼为双顶重檐卷棚歇山式两层建筑上有凉台下设回廊。由此向北沿鹅卵石小路前行便到漪澜阁此阁也建于水中两边各有小石桥与岸相连。阁前有平台伸在水中昔日供赏月、演戏等用。此阁现为洪秀全纪念馆内陈列洪秀全坐姿石膏像、天朝宫殿模型及太平军用过的大炮、兵器等。湖东与夕佳楼遥遥相对的是三楹的忘飞阁中间一楹伸向湖中造型奇特现辟为澳台胞休息室。此阁始建于康熙年间原为两层。同治年间改建为现状据传曾有飞鸟歇此阁上见景美而忘飞故称忘飞阁。出忘飞阁见棕榈亭已是桐音馆后面。东边还有游廊廊尽头是碑亭亭内有清代学者俞越书唐人张继诗《枫桥夜泊》碑一座。花园的西南角围墙边有一座望亭是全园的最高点登此亭上全园景色尽收眼底。此亭又称印心石亭。

西花园的西侧有幢西式平房原系清末两江总督端方的私人花厅共7间。1912年元旦孙中山在这里就任临时大总统。现正中一间有孙中山先生石膏坐像两边墙上是临时政府大事记。平房西边3间贯通为总统会议室东边第一间为会客室第二间为办公室最里间是休息室现均按原貌布置供游人观瞻。从西花园东北角走进一个院落是孙中山先生的起居室。主要建筑是一座三开间中式木结构二层楼。楼下是卫士室楼上中间为餐厅西边一间是浴室东边一间为卧室。楼下厢房内陈列着孙中山与宋庆龄的革命史迹照片等。