事业机关南宁市直接管辖。[7] 1996年，武鸣县辖11个镇、5个乡、1个国营华侨农场：城厢镇、城东镇、陆斡镇、锣圩镇、太平镇、双桥镇、宁武镇、仙湖镇、府城镇、两江镇、罗波镇、灵马乡、马头乡、甘圩乡、玉泉乡、上江乡、华侨农场。县政府驻城厢镇。

2000年6月20日，广西壮族自治区政府批准甘圩、灵马、马头等3个乡改为镇建制，各乡改镇后原辖行政区域不变。[7]

2003年末，武鸣县辖14个镇、2个乡：城厢镇、城东镇、两江镇、马头镇、陆斡镇、罗波镇、太平镇、双桥镇、甘圩镇、宁武镇、锣圩镇、仙湖镇、府城镇、灵马镇、上江乡、玉泉乡；以及武鸣伊岭经济技术开发园区。

2004年末，辖2个乡、14个镇，共198个行政村和20个社区、3415个村

?

1

民小组、1770个自然屯。[7]

2005年6月25日，《南宁市人民政府关于调整部分乡镇行政区划的通知》：撤销城东镇建制，城东镇整体并入城厢镇，扩大城厢镇的管辖范围。撤销上江乡建制，整体并入太平镇，扩大太平镇的管辖范围。撤销玉泉乡建制，整体并入锣圩镇，扩大锣圩镇的管辖范围。至此，武鸣县辖13个镇：城厢镇、两江镇、马头镇、陆斡镇、罗波镇、太平镇、双桥镇、甘圩镇、宁武镇、锣圩镇、仙湖镇、府城镇、灵马镇。[7]

2005年9月，南宁华侨投资区国务院批准更名南宁东盟经济开发区省级开发区[8] 划归南宁市政管辖。

2013年，南宁东盟经济开发区国务院批准国家级开发区划归南宁市政管辖[8] 。

2014年，南宁东盟经济开发区国务院批准更名国家级广西东盟经济技术开发区划归南宁市政管辖[8]

2015年2月，国务院批准同意广西壮族自治区调整南宁市部分行政区划，决定撤销武鸣县，设立南宁市武鸣区，以原武鸣区的行政区域为武鸣区的行政区域，武鸣区人民政府驻城厢镇兴武大道245号。[9]