缙云米仁栽培历史悠久，早在元至正八年(公元1348年)编撰的《仙都志》中就有“薏苡仁”的记载。在轩辕黄帝丹药的配方中就有缙云米仁一味。在每年的重阳节黄帝祭祀大典上，当地百姓供奉的物礼少不了缙云米仁，百姓们在以往的长期生活中，也积累了大量利用缙云米仁来养生保健的经验。目前，在民间还普遍采用猪肚装苡米煮着吃，来“健脾益胃、补肺清热、祛风胜湿、炊饭食、利小便”。或用苡米酿造的黄酒食用，来“健脾益胃、清热祛湿、补肺和增强免疫力。民间小调唱道：“苡米胜过灵芝草，药食营养价值高，常食可以延年寿，返老还童功劳高”。

在自给自足的农耕时代，缙云民间历来就有在田头地角或低洼田块或沟渠边种植米仁的习惯，但由于粮食的紧缺、商品化程度不高等因素制约，长期来没有形成大的规模。改革开放后，缙云米仁有了长足发展，特别是进入20世纪后，缙云米仁被浙江康莱特集团有限公司生产的“注射液用薏苡仁油”指定为专用生产原料，使缙云米仁有了稳定的销售渠道。近年来种植面积稳定在5000亩左右。为缙云米仁逐步走向基地化、规模化、标准化生产奠定了坚实的基础。

2011年9月，县政府确定缙云米仁产业协会为缙云米仁农产品地理标志登记申请人。经过申请人申请，省级农产品地理标志工作机构组成专家组进行产品品质鉴评、检测机构出具产品检测报告，2013年12月通过农业部专家组的评审。

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