学校分中医专修班、中医专科班和中医少年实验班3个班次。中医专修班、中医专科班学制3年，中医少年班学制6年，强化《内经》、《伤寒论》、《周易选读》等经典著作的教学，开设了中医外科、骨伤、妇科、儿科、眼科、针灸等6个急需短缺的专科类专业，为中医小科培养实用的后继人才。学校还建立了附属医院和校刊《国医论坛》编辑部。

建校以来，以研究仲景学说为重大课题，取得了一定的成绩。副校长、副教授廖国玉编写的5集电视连续剧《张仲景》，1987年已经向全国播放，十集电视艺术教学片《伤寒论》开创了中医形象化教学的新路子。专家评论说，这是中医经典教学改革的一个创举。1985年以来共发表中医学术等论文81篇，学术著作10部。同时先后同日本、新加坡、美国和港台地区建立了学术交流关系。

张仲景国医大学位于河南省南阳市武侯街道，是国家教委发布的全国131所高等医药院校中唯一独立设置中医药专科的学校，占地11公顷，建筑面积2.1万平方米，建立于1985年，以弘扬仲景学说为办学宗旨，以培养急需的实用型中医专科人材为特色。