宝林寺原址在佛山市顺德区大良镇内的凤山南麓，初名柳波庵。始建于公元10世纪的五代南汉末期，宋代重修时扩大规模。元代高僧德钦在此潜修至圆寂，僧众在寺内建“肉身堂”安奉涂漆遗体。清康熙年间重修扩建后，易名“宝林寺”，取“净土七宝树林”之意。其后，县衙在寺内增建“万寿宫”，供吏员向帝、后祝寿及恭听“圣谕”之用。20世纪中期，此寺大部分拆卸扩路和兴建文化公园。1995年，剩余建筑物全部拆除，另在太平山西麓重建新寺，依山构筑，巍峨壮观，成为顺德旅游一大景点。

俗说：“未有顺德，先有宝林；考之志乘云：其先海滨一孤寺，始建于五代之南汉殇帝光天一年(公元942年)，历今千余年。沧桑风雨，宝林寺至明景泰初，遂成地方首刹。顺德开县之始(明景泰三年， 1452年)，每遇国家大典或开读朝廷诏令，则地方长老绅耆仍集合寺庭举礼，宝林寺作为佛教场所，香火兴盛，香客众多。
由于历史原因，原宝林寺殿堂后来移作它用，再因旧城改建，寺院旧貌已难以复原。
在改革开放以来，党的宗教政策进一步落实，原宝林弟子信众及众多港澳台同胞和海外侨胞回乡探亲，纷纷要求重建宝林寺，后经省宗教部门批准，由市有关人士组成筹建委员会募资重建。此举深得海内外社会贤达、八方善信的鼎力支持，慷慨解囊，乐施善财，诚笃捐资，共襄善举，使宝林寺的重建得以顺利进行。
重建选址在市南太平山麓，左环德胜河，右瞩旧寨、青云双塔，展拓山地十二万平方米，其中八万三千平方米建为寺前公园和居士林，而主体殿阁依山布局，共有建筑面积一万二千平方米。山门壮丽，佛殿庄严，经阁爽垲。三宝珠佛来于天台山，金贴之五百罗汉由浙江东阳能工巧匠雕造，具有很高艺术价值，碑廊展现来自全国三十多个省市书法名家的杰作，增添了寺院的文化氛围，古树奇木的引进又显示着园林特色。一座比原址更为壮丽的禅林成为顺德的佛门圣地。
宝林寺自一九九八年开光以来，得到社会各界的支持和称誉。2000年被广东省佛教协会授予佛教文明寺院。