苗族信仰原始宗教。敬天地，信鬼神，因而巫术不断。人生病时认为是鬼神作祟，要占卜算命，有的还要请巫师“走阴”探究，或祭祀，或驱赶，以求平安祥和，万事如意。苗族崇拜的对象主要有山石、大树、岩洞、木桥、水井、土地菩萨等。

逢年过节祭献祖先，要在神龛、堂屋、大门、灶、柱、火堂、碓、磨、畜禽厩等处插香，烧纸钱，家长坐于神龛前，逐一向列代祖宗祭献(有三、五、八代不等)，祈求保佑人畜平安，五谷丰登。

苗族信仰山神、龙神、牛鬼、进门猪鬼、老母猪鬼等。认为山神是六畜保护神，五谷神是田公地母。祭“进门猪”(俗称“火笼猪”)是苗族祈求养猪兴旺的一种信奉活动，有的还很有究竟，如果家里养的母猪产了“五花猪”(脑门和四肢有花斑)，主人就要按照俗定，择日子，将这头小猪宰杀祭祀。有的人家养猪不长，主人许诺，也要按照诺言兑现。到祭祀时，主人要邀请亲朋好友相聚，杀猪祭祀，祭祀完毕，家人和亲友一起享用，必须一顿吃完，不准带出门。祭“老母猪鬼”也是苗族的一种信仰活动，当主人需要时，就择日邀约亲戚朋友，到人烟罕至的深山或者岩洞里，将一头肥母猪宰杀祭祀，以祈求“老母猪鬼”保佑家中猪群无病无灾，多仔快长，祭祀后猪肉也要尽量吃完，剩余不能带回家。祭“牛鬼”大体与祭“老母猪鬼”相同。到水稻扬花灌桨的时节，苗族就要祭“谷神”，主人要带上一把刀、一只鸡和香与钱纸，去田里用竹木条搭一个小祭台，插香烧纸，杀鸡祭献谷神，祈求谷神保佑，庄稼丰收。

天主教。光绪二十六年(1900)法国传教士金梦旦到文山地区传播天主教教义，发展教徒。先后在开化城书院街、所树革、五色冲、步犁村、倮么村等地建立天主教堂，有25个村寨104户加入天主教，其中苗民占一部分。1956年文山全区信仰天主教的苗民有125户540人。1958年仅广南县苗民就有120户540人信奉天主教。1959年，文山县马塘镇、喜古乡、阴风寨共有天主教徒17户，其中苗民教徒48人，阴风寨教徒全是苗民，会长杨正林和马塘教堂神父李文珍、李文才、马跃武、张文照等人亦为苗族。1951年后教徒锐减，上世纪90年代初宗教活动才得以正常恢复。1984年，成立文山县冷水沟天主教事务管理委员会，主任陶自祥，副主任熊保文、杨国忠，成员11名。1993年，文山县发展到10个教会片区，有教徒232户1247人。其中冷水沟22户，岩头村11户，水丰寨39户，丫口、车期27户，老者底、姑娘寨、洪水塘、古老冲32户，散片山、小河、新发寨23户，新寨12户，羊山坡、阿富、油房坝25户，红石硐、老直冲、水淹坝、水尾25户，马保山16户。砚山县鲁都克有苗民教徒180人，1986年苗族熊子钦任鲁都克天主教管理委员会主任。