B2B电子商务有多种交易模式。关键模式有两种：企业自建B2B模式和多对多市场模式。

（1）企业自建B2B模式。指企业基于自身的信息化建设程度，搭建以自身产品供应链为核心的行业化电子商务平台。企业通过自身的电子商务平台，串联起行业整条产业链，供应链上下游企业通过该平台实现资讯交换、沟通与交易。目前国内自建网站运作B2B模式的大型企业有海尔、联想等。

在以企业为中心的交易模式中，由一家企业进行所有销售，称之为卖方市场，在卖方市场中，企业通过基于web的私有销售渠道向企业客户提供商品。小型企业一般使用互联网，并采取一定的加密手段。卖方可以是制造商或分销商，向批发商、零售商和大企业直接销售，即一个卖家对应于多个潜在的买家。

由一家企业进行所有的购买，称之为买方市场，B2B独有的一项特色是买方市场及其在采购方面的应用。当买方进入卖方市场后，其采购部门必须将订单信息手动输入到信息系统中，在电子商店或电子商城中搜素和比较供应商及产品的速度慢、成本高，因而，一些大型买方企业开放自己的市场使之成为买方市场。

（2）多对多市场模式。多对多市场模式与我们前面提到的以企业为中心的B2B交易模式不同，多对多市场模式涉及许多买家和卖家。他们都是公开的电子商务，有许多称呼和多样化的功能。

不同行业的B2B电子交易市场在功能上可能有一定的差别，但总的来说都属于信息发布平台类网站。例如，中国食品网站（www.foode.cn）是专业的食品电子交易网站，采用先进的支付手段为各类食品生产企业、半成品原材料供应企业、原材料提供商、食品包装生产企业、食品机器设备供应企业....以及全国各地的食品代理商和批发商提供网上招商与采购的综合信息平台。