重庆轨道交通（Chongqing Rail Transit）是中华人民共和国重庆市的城市轨道交通系统，由重庆市轨道交通（集团）有限公司运营。

重庆主城区地理条件复杂，已建成的轨道交通线路采用以下两种制式：跨座式单轨，应用线路有2号线、3号线；传统钢轮钢轨铁路，应用线路有1号线、6号线、国博线。两种制式在建设成本，适宜环境，噪音控制，速度运力等方面各有不同。

于2004年11月6日开始载客运营的重庆轨道交通2号线，不仅是国内首条跨座式单轨线路，也是西部地区第一条城市轨道交通线路。2号线用40年的271亿日本政府提供的政府间发展援助（ODA）日元贷款建设。

重庆轨道交通1号线是山城重庆开通运营的第一条地铁线路，重庆轨道交通3号线是国内第一条跨越长江的城市轨道交通线。

目前已开通重庆轨道交通1号线、2号线、3号线、6号线、国博线，重庆城市轨道交通运营里程数居中国中西部城市首位。随着2012年12月20日轨道交通1号线沙大段20.2公里开通运营，重庆轨道交通运营里程突破100公里，成为中国大陆第6个城市轨道交通运营里程突破100公里的城市。目前，重庆轨道交通运营里程已经突破140公里，运营里程稳居中西部城市首位。