唐长兴四年（公元933年），自“山自永福里，水自清源里，会于治所”中取山水各一字，定名福清。
    唐圣历以前：1957年，福建省文物管理委员会在东张进行文物普查时发现新石器时代的遗址。这表明4000年前新石器时代，福清这块土地上就有人类居住。
    周朝，福清属七闽地。
    战国时，福清属闽越地。
    公元前221年，秦始皇统一中国，福清属闽中郡，从此纳入全国行政区划。
汉高祖五年(公元前202年)福清属闽越国；元封元年(公元前110年)，福清属会稽郡(郡治在今苏州)冶县。
    东汉建安十五年(210年)，福清属会稽南郡侯官县(治所在今福州)。
    三国时，福建为吴地，永安三年(260年)，福清属扬州建安郡。
    晋朝，福建分建安、晋安(郡治所在今福州)两郡。太康三年(282年)，福清属扬州晋安郡原丰县；元康元年(291年)，福清属江州晋安郡原丰县。
    南北朝时期，福建境内曾出现建安、晋安、南安三郡。宋泰始四年(468年)，改晋安郡为晋平郡(后复为晋安郡)，福清属江州晋平郡原丰县。南齐时，属江州晋安郡原丰县。梁时，属东扬州晋安郡原丰县。陈永定元年(557年)，属闽州(今福州)原丰县；天嘉六年(565年)，属东扬州晋安郡原丰县；光大二年(568年)，属丰州原丰县。
    隋朝灭陈后，把丰州改为泉州，州治设在今福州，代表福建全省的名称。隋开皇九年(589年)，福清属泉州原丰县；开皇十三年(593年)属泉州闽县；大业二年(606年)，泉州改名闽州，属闽州闽县；大业三年(607年)，闽州改名建安郡，属建安郡闽县。
    唐武德元年(618年)，改建安郡为建州，福清属建州闽县；武德六年(623年)，建州又改为泉州，析闽县置新宁县，不久，又改新宁县为长乐县，福清属泉州（今福州）长乐县。
    唐圣历至今：唐(武后)圣历二年(699年)，析长乐县南八乡置万安县，以八乡中的万安乡取名，属泉州(今福州)；唐景云二年(711年)，泉州又改名闽州，万安属闽州；开元十三年(725年)，改闽州为福州，万安属福州；天宝元年(742年)，取“造福唐朝”之意，万安县更名为福唐县(亦说县治下有个福唐里而名)，改福州为长乐郡，属长乐郡。乾元元年(758年)长乐郡复为福州，福唐属福州；元和三年(808年)，长乐、侯官两县划归福唐县管辖，元和五年(810年)，复长乐、侯官两县。
    五代后梁开平二年(908年)，福唐县改名永昌县，属福州。后唐同光元年(923年)，复为福唐县，属福州；长兴四年(933年，闽龙启元年)，闽王王延钧称帝，升福州为长乐府，根据“山自永福里，水自清源里，会于治所”一语中“永福”、“清源”各取一字，改福唐县为福清县；属长乐府，从此福清县名沿用至今。后晋开运二年(945年)，王延政改长乐府为东都，福清属东都。后汉乾祐元年(948年)，福清属福州威武军。后周广顺元年(951年)，福清属彰武军。
    北宋太平兴国三年(978年)，福清属福州；南宋景炎元年(1276年)，升福州为福安府，福清属福安府。
    元至元十五年(1278年)，福安府改为福州路，福清属福州路；元贞二年(1296年)，因户满4万，升福清县为福清州。
    明洪武元年(1368年)，福州路改为福州府；洪武二年(1369年)，福清州复为福清县，属福州府。
清代，福清属福州府。嘉庆三年(1798年)，析海坛岛置平潭建军厅，直属福州府。
    民国2年(1913年)，废府置道，福清属闽海道；民国14年废道，福清直属省辖；民国22年12月，中华共和国人民革命政府在福州成立，福建划为四省，两个特别市，福清属闽海省；民国23年，全省划为10个行政督察区，福清属第一行政督察区；同年8月，南日岛归福清管辖；民国24年7月，南日岛直属省辖；9月10日，又归福清管辖；同年10月，全省划为7个行政督察区，福清属第一行政督察区；民国25年12月，南日岛直属省辖，此后脱离福清。
    1949年8月16日，福清解放，属林森专区；1950年改林森专区为闽侯专区，福清属闽侯专区；1956年，闽侯专区撤销，福属晋江专区；1958年4月4日，永泰县的东山、善山、一都3个乡划归福清管辖；1959年8月15日，恢复闽侯专区，福清属闽侯专区；1971年7月，撤销闽侯专区，成立莆田地区，福清属莆田地区；1983年7月1日，福清改划为福州市管辖。1990年12月26日撤县建市，仍属福州市。2005年12月，省、福州市正式批准福清市中心城区行政区划调整方案，同意撤销音西、阳下、宏路等3个镇和融城街道办事处建制，析出海口镇的8个村委会，整合设立玉屏、龙山、龙江、音西、宏路、石竹、阳下等7个街道办事处。2006年12月15日，福清7个街道办事处正式成立。