截至2013年，井研县辖10镇，17乡：研城镇、马踏镇、竹园镇、研经镇、周坡镇、千佛镇、王村镇、三江镇、东林镇、磨池镇、集益乡、纯复乡、三教乡、高滩乡、宝五乡、四合乡、黄钵乡、胜泉乡、门坎乡、石牛乡、高凤乡、金峰乡、分全乡、镇阳乡、天云乡、乌抛乡、大佛乡。

井研县位于四川盆地西南，县城北距成都市142千米，西至乐山市37千米，东南至自贡市118千米，地理坐标为：东经102°55′—104°00′，北纬28°25′—29°55′，与仁寿、青神、荣县、犍为、五通桥、市中区等地接壤。 地貌 井研县地势低矮，海拨高程在380米－450米之间；丘陵广布，溪沟纵横。茫溪河流域多浅丘，西北部和东部边缘多深丘，丘陵地表组成物质较单一，主要是中生代红层，软硬相间的紫红色砂泥岩，另有少量石灰岩。 按形态分为4类： 深丘和低山：境内西北部，包括天云、镇阳、乌抛全部和石马、周坡、分全乡的一部分，面积135平方公里，占井研县幅员面积15.7%，一般海拨450－650米。境内有龙泉山余脉，铁山支脉。 中丘：范围有黄钵、胜泉、门坎、东林乡全部和金峰、集益等，面积338平方公里，占幅员面积39.3%。 浅丘：分布在研城、马踏、竹园、研经等靠近茫溪河两岸的大部分乡村，面积371.15平方公里，占幅员面积43.1%。 平坝：主要分布在茫溪河及其支流的两岸，面积约15平方公里，占幅员面积1.78%；海拨在365米以下；相对高程7－10米；坝宽100－300米。[2] 气候 井研属四川盆地中亚热带湿润气候区，气候温暖湿润，雨势同季，雨量充沛，但分布不均，冬无严寒，夏无酷暑，日照稍缺，冷热四季分明，干湿两季分明，年平均气温17.2℃，年平均日照总数1134.6小时，年平均降雨量1025.8毫米，全年无霜期334天，四季特征是：春季回暖早、冷空气活动频繁，气候多变；夏季气温高，光照多，雨量集中；秋季气温下降快，多阴雨；冬季多阴天、少雨雪，常发生冬旱。