宝应县建成省初级卫生保健先进县，通过了省级卫生城和省环

境综合整治优秀县城验收。截止2013年，拥有各类卫生机构38个，其中医院、卫生院33个，拥有病床1294多张。其中县医院524张。共有卫生技术人员2024人，其中医生899人；拥有中西医师605人、护师和护士559人、卫生防疫和防治人员79人。卫生工作多次获得省市表彰，县人民医院在江苏省率先跨入二等甲级医院行列。
2013年，宝应县改造提升乡镇卫生院6个，政府回购民营医院6家。建成市卫生镇1个、省市卫生村10个，建成省“慢病防控示范县”。免费为 10万 65岁以上老年人开展健康检查；大力普及健康素养和卫生防病知识，建成建康小屋20个，健康步道10个，健康主题公园5个，开展健康咨询、义诊活动60场次。宝应县参合人数达66.23万人，较去年净增2.69万人，参合率达99.66%；新农合及居民医保筹资标准提高到350元，参合农民受益259.3万人次。