孔庙是祭祀孔子的家庙，全国仅存的两个孔氏家庙之一，为全国重点文物保护单位。衢州孔庙素称南宗，具有700多年的历史。按山东曲阜孔庙的规模建造，亦分孔府、孔庙两部分。庙内古木参天，殿宇宏伟，思鲁阁前的“先圣遗像”碑，据传为唐吴道子所绘，极为珍贵。整个古建筑群肃穆凝重，洋溢着浓郁的儒家文化氛围。据史料记载，北宋末年，金兵南侵，宋高宗赵构仓促南渡，建都于临安，孔子第48代裔孙孔端友，负着孔子和孔子夫人的楷木像，离开山东曲阜，南迁至此，后敕建孔氏家庙，为宗庙。

　衢州孔庙曾经三迁三建，十多次修葺。现址的孔庙为明·武宗正德十五年(公元1520年)所建，位于衢州府城东隅，占地约20亩，基本上是按照山东曲阜孔庙的规模来规划建造。建筑占地面积约13900平方米，分为孔庙、孔府及后花园三部分。

整个建筑群坐北朝南，平面呈纵长形，以3条轴线布局。东轴线上有孔塾、崇圣门、崇圣祠、圣泽楼等建筑。中轴线上有孔庙大门、大成门、甬道、大成殿、东西庑等建筑。西轴线上有五支祠、袭封祠、六代公爵祠、思鲁阁等建筑。西轴线稍西为世袭博士署，即孔府的奉祀官府。家庙历经各代的多次维修，至今仍保留有宋代的建筑形制和规模。

庙前设有“金声”、“玉振”、“棂星”、“大成”四门。前左为“金声门”，右为“玉振门”，金声、玉振两门之外，有“德侔天地”、“道冠古今”两块牌坊。庙门为一座单体歇山顶建筑．在石须弥座的围墙衬托下，显得威严庄重。庙门上方，悬挂着一块由当代著名书法家沙孟海题字的“衢州孔氏家庙”额，字体苍劲有力。正门两边一对石狮，显示出圣地的尊严。据了解，庙门是根据明代衢州孔氏家庙图，结合清代建筑风格重新设计证。进而正中，立石结构三拱式的“棂星门”，再进为“大成门”，门之左右均为碑亭，立宋宝祐间祀部尚书、翰林学士赵汝腾撰写的创建家庙碑等十七块碑石，碑文均由当朝政要，社会名儒撰记。

进大成门可上佾（yì古代乐舞的行列，一行八人叫一佾）台，是祭祀孔子时歌舞的地方一座全部由青石铺成的170 个方米的佾台，紧接佾台的是孔庙的主殿大成殿，是庙内的最高建筑，这是一座重檐歇山顶明代建筑，殿阁雄伟、气势不凡。双重飞檐中立有一块竖匾，上书“大成殿”三字，檐下挂着“生民来有”匾额，为清代雍正皇帝砌笔。殿内一块清代康熙皇帝撰写的“万世师表”原额，悬挂在正殿上方。大殿高23米，长和宽各9米。殿内正中是孔子座像，两旁侍立着其子伯鱼及孙子思像。横梁上悬有十余块历代帝皇御书匾额。殿内共有木质圆柱12根。其中最大的圆柱周长1.80米，大人伸展双臂也难以抱全。殿前通道的东西两侧各有九间房子，叫“两庑”，挂供奉先贤的地方。东西两庑祀十二哲、中兴祖孔仁玉以及孔传、孔端友。

金声门左，是家塾所在，内进为祟圣祠，祠后是圣泽楼、旧称御节楼，祠前稍西为报功祠，祀官绅之有功于南宗者。玉振门右有五支祠、袭封祠、六代公爵祠及思鲁阁等建筑。思鲁阁上奉孔子及亓官夫人楷木像，像高不足两尺。孔子长袍大袖，亓官夫人长裙垂地，形象生动。阁下立有“先圣遗像”碑，碑高2.07米，宽0.85米。相传为孔端友根据唐代画家吴道子手迹摹刻的。

在家庙之西，连接世袭翰林院五经博士府（俗称孔府或博士衙门）。博士府后进为内宅，与家庙大成殿齐平。

4家庙主要建筑 　　崇圣祠：祠祀孔子五世祖：孔子父纥梁公，祖父伯夏，第三世祖防叔公，第四祖祈义，第五世祖木金父。

功祠（又名思官祠）：祠祀有功于孔氏南宗乾。如宋代宝祐年间，为鼎建家庙，克尽全力的衢州知州孙子秀，明弘治至正德年间为孔氏南宗的复兴，而尽全力的吏部郎中周木，衢州知府沈杰、清同治年间，帮助孔氏南宗办学的浙江巡抚左宗棠等人。

五支祠：祀孔氏五支之祖。

六代公爵祠：祠祀自孔端友至孔洙六代衍圣公。

袭封祠：祠祀孔彦绳圣孔庆仪十五代翰林院五经博士。

圣泽楼：存放皇帝和朝廷给于孔裔的文墨和赠品。

思鲁阁：衢州孔庙人成殿西侧，有一座曲阜孔庙所没有的建筑，名曰“思鲁阁”。在孔庙建立思鲁阁，这在全国也是绝无仅有的。“思鲁”是叫南宗孔氏子孙不忘故之意，“思鲁阁”正是南宗孔氏子孙为表达他们思念山东曲阜和家人而精心设计建造的。

以上建筑（除崇圣祠）是天下孔庙所没有的。这也就是孔氏衢州家庙特色的所在。