2003年11月，中法考古专家第一次联合对该遗址进行了发掘；2004年，中法第2次联合考察，发掘出一批动物骨化石，有象、鹿、牛等，而且以腿骨为主，反映了巫山人早期的生活图景。此次中法考古专家是第3次联合考察，历时13天的考古发掘工作十分艰辛。

上世纪80年代末，有关“巫山人”遗址的重大发现，曾一度轰动世界。发掘出土的204万年前“巫山人”左侧下颌骨化石，至今保存在三峡博物馆。

经过三次大规模发掘以及国内外学者多年来的研究，推测在巫峡中发掘出的古人类化石，代表着“巫山人”是我国迄今发现得最早的能人。但是,由于化石材料的缺失“巫山人”是人是猿尚有巨大的争议,国际古生物学界对“巫山人”也有不小分歧。“巫山人”遗址的第四次大规模发掘，就是期望找到更多证据，证实这种古人类存在的事实。于2011年11月，科考队在龙骨坡遗址搭棚，以避免日晒雨淋可能对发掘剖面文化层造成的破坏。龙骨坡遗址的第四次大规模发掘已经开始。[4]