南充市位于四川盆地东北部，嘉陵江中游，介于北纬30°35′——31°51′、东径105°27′——106°58′之间。南北跨度165公里，东西跨度143公里。东邻达州市，南连广安市，西与遂宁市、绵阳市接壤，北与广元市、巴中市毗邻。幅员面积12494平方公里。
南充市可分为北部低山区和南部丘陵区两大地貌单元，地势从北向南倾斜，海拔256～889米。地貌类型以丘陵为主，浅丘平坝、中丘中谷、高丘低山类型大体各占1/3。地震基本烈度为6度。[5]
南充市属于中亚热带湿润季风气候区，四季分明，雨热同季；光热水主要分布于农作物生长区；气候特征：春早、夏长、秋短、霜雪少、冬暖；年平均气温17℃左右；年日照时间处于1200-1500小时范围内；年降雨量1100mm；灾害性天气（如秋绵雨、干旱、洪涝、大风、冰雹等）频率较大，持续时间较长，全年以西北风为主。
南充市境内主要的河流有嘉陵江、西充河、虹溪河、东河、清溪河、枸溪河、白溪河、螺溪河，均属于长江流域。
自然资源矿产资源
南充境内金属矿产贫乏，部分非金属矿产储量丰富。[5] 南充地下盐矿资源极其丰富，南充盐盆是西南地区最大、位居全国前茅的天然盐矿，盐岩地质储量1.8万亿吨[6] ，石油储量7779万吨，天然气储量1千亿立方米。另有砖用页岩5292.9万吨，主要分布在市辖三区和阆中市；建筑用沙砾64318万立方米，主要分布在市辖三区、蓬安县、阆中市和南部县；砖瓦用粘土566.52万吨，主要分布在阆中市、南部县和西充县；膨润土4.84万吨，主要集中在营山县。南充市水资源总量为400多亿立方米。多年平均径流量深335mm，地表多年平均径流总量41.91亿立方米，全市人均拥有水量600m，低于全省和全国的平均水平。
土地资源

南充土壤包括5个土类、10个亚类、31个土属、85个土种，其中以紫色土、水稻土为主，紫色土约占全市土壤面积的60%。
生物资源

南充动植物种类繁多，共有植物近2000种，其中药用植物700余种，属中国重点药用植物300多种。