主体建筑坐北朝南，外形设计为上小下大、平顶四阿的覆斗形，风格独特，古朴庄重，整个馆内外，环境幽雅。现有3个展室，第一陈列厅主要反映秦人、秦民族、秦宫殿；第二陈列厅主要陈列秦宫发掘区出土文物；第三陈列厅主要陈列秦咸阳城历史沿革及保护规划。文物库房面积近100平方米，藏品500多件，其中珍贵等级文物28件。

为推动秦咸宫遗址的保护利用工作，经积极争取，2005年，秦咸阳宫遗址保护被列为陕西省大遗址保护重点项目。

秦咸阳宫遗址是我国战国时期秦国的都城遗址，位于陕西省咸阳市渭城区窑店镇北塬一带，西距咸阳城区15公里。北起高干渠，南至渭河，西起渭阳镇塔尔坡，东至正阳镇柏家咀，东西12公里，南北6公里，保护面积72平方公里。1988年，被国务院公布为全国第三批重点文物保护单位，1994年8月被确定为陕西省重点保护的四大遗址之一，2000年被评为二十世纪中国一百项重大考古发现之一。