太湖水域辽阔，面积现有3.64万顷，历来多用“三万六千顷”来称太湖之广阔，太湖湖底高程-0.25米，湖底较为平坦，其地势为东高西低，同陆上地形相反；平台山岛西北有一条东南—西北走向的新月形凹槽，为太湖最深处。在多年平均水位2.99米时，容积44.28亿立方米。太湖河港纵横，河口众多，1967年有进出河道315条，1980年时有220条。现有入湖河流70余条，集水面积18500平方公里。入湖水道多源于西部山区，有源于天目山的苕溪水系和合溪，源于宜溧山区的南溪及源于茅山的洮滆水系等。出口河道多集中在太湖东部和北部。太湖主要出水口有沙墩港、胥口港、瓜泾口、南厍港等。古代，娄江、东江和吴淞江是引太湖水入海的主要河道，合称“三江”，当前主要出水河道有属于黄浦江和江南运河两大水系的黄浦江、吴淞江、望虞河、浏河、白茆河、太浦河、梁溪河等。太湖水系呈由西向东泄泻之势，平均年出湖径流量为75亿立方米，蓄水量为44亿立方米。正常年份，每年5月雨季开始后，入湖径流增加，太湖水位开始上升；7~8月，水位升至最高值，有时9~10月台风过境，最高水位可能推迟；其后水位下降，直到翌年4月，该阶段一般是西高东低，湖流较弱，无风时，以正常的倾斜流为主，基本流向由西南向东北，流速一般在每秒10厘米以内，个别水势较急的湖区，流速可达30厘米每秒。太湖风壅水位变幅，通常为0.2~0.3米，在较大风力持续作用下，水位变幅最大可超过1米。