济宁市第一人民医院前身为美国基督教北长老会所属巴可门医院，于1896年（清光绪二十二年）在济宁牌坊街路东建立，隶属牌坊街路西济宁基督教长老会。
1932年更名为德门医院。1941年更名为中华基督教会医院，隶属于日本同仁会。1945年恢复德门医院名称，隶属于济宁基督教长老会。济宁市第一人民医院有314项科研成果通过鉴定，256项获得国家、省、市级科技进步奖。医院与美国、日本、荷兰、加拿大、澳大利亚、瑞典、新加坡、马来西亚等国家进行了业务交流与协作。
1949年建立济宁市立人民医院，隶属于济宁人民政府。1950年改建为山东省立医院第三分院，隶属于山东省卫生厅。1953年更名为济宁专区第一人民医院，隶属于济宁专署卫生科、济宁专署卫生局，济宁专区卫生局。1967年更名为济宁地区人民医院，隶属于济宁地区卫生局，济宁地区行署卫生局。
1983年更名为济宁市第一人民医院，隶属于济宁市卫生局。

经过115年的发展，医院现已成为山东省鲁西南地区规模最大的学科门类齐全、医疗设备先进、专业特色突出的三级甲等大型综合医院，是山东省首家“卫生部脑卒中筛查与防治基地”，山东省医学科学院附属济宁市第一人民医院、中国人民解放军山东陆军预备役炮兵师医院、中国医科院血液病医院济宁分院、济宁医学院教学医院、安徽医科大学济宁临床学院。
医院现拥有总院本部、血液病医院（西院区、市中区人民医院）、儿童医院、肿瘤医院（北院区）、消化病医院、高新区分院和市老年福利医疗保健中心等集团院区7个，总院开放床位为2800张；正在建设中的高新区分院占地543亩，规划建设2200张病床。

济宁市第一人民医院，位于孔孟之乡、运河之都的山东省济宁市市中心，是一所专业科室齐全、医疗设备先进、技术特色突出、鲁西南地区唯一的三级甲等医院和医疗教学科研中心，是济宁市第一人民医院医疗集团核心医院，是山东省医学科学院研究生教学医院和济宁医学院教学医院。

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