白音敖包国家级自然保护区位于旗西北部，距克什克腾旗政府所在地经棚镇75公里，与贡格尔草原毗连。2000年4月国务院批准在白音敖包建立国家级自然保护区，主要保护对象是沙地云杉林生态系统，保护区总面积13862公顷，其中沙地云杉林面积为1947公顷。沙地云杉林是世界上非常特殊的森林生态系统类型，是长期自然历史发展和现代自然条件综合作用下形成的特有树种，是目前世界上仅存的一片沙地云杉林，也是我国云杉母树繁育基地，因此，有“生物基因库”、“生物活化石”之称。云杉形似塔，干红叶绿，挺拔刚劲，四季常青，树姿优美，是园林观赏和城市绿化的最佳树种。本区地处蒙古高原东南边缘，浑善达克沙地东北部的草原上，位于我国东北，华北和大兴安岭植物分布交错地带，区内地貌类型主要为沙地、低山丘陵和河谷等，海拔高度在1300―1500米，植物以蒙古系为主，据不完全统计共有高等植物68科239属460种。区内分布有大面积的天然沙地云杉林，被学术界称为“在内蒙古高原草原区残存的唯一的一个暗针叶林天然生物基因库。”保护区独特的地理位置还为野生动物提供了较为理想的栖息繁衍和停歇场所，形成了较为复杂的野生动物种群，境内分布的国家重点保护野生动物有大鸨、灰鹤、天鹅、蓑羽鹤、马鹿、猞猁等。白音敖包保护区的建立，对于保护“三北”防保护林体系东部地区天然森林植被，保护当地的生态环境和草原畜牧业，研究沙地云杉的起源和分化均有着非常重要的意义。

白音敖包是蒙古语，意思是“富饶的山”，山上有蒙古族祭祀的大型敖包，每年农历五月十三日这里都举行具有浓郁民族特色的敖包祭祀活动。当晨曦微露，来自草原深处的牧民们摆上手把肉、奶食、奶酒，绕敖包按顺时针转三圈，洒酒为祭，祈祷草原风调雨顺、五畜兴旺。