博兴县历史悠久。在利城、村高、曹家等村庄发现的龙山文化遗址证明：远在4000多年前（新石器时代），境内已是父系氏族社会，是比较稠密的人烟聚居区。

1940年中国共产党领导人民建立了山东省临时参议会及山东省战时工作推行委员会。是年秋，共产党领导的博兴县抗日民主政府建立。1941年省战时工作推行委员会划全省为胶东、清河、冀鲁边区、鲁中、鲁南、鲁西6个行政区，博兴县属清河行政区。1943年9月省战工委改为省战时行政委员会，领胶东、鲁中、鲁南、清河、冀鲁边5个主任公署及滨海直属专员公署，博兴县属清河主任公署。1945年8月13日，中国共产党领导下的山东省政府成立，划全省为胶东、鲁中、鲁南、渤海、滨海5个行政公署，领21个专员公署。9月，博兴县抗日民主政府更名博兴县政府，属渤海行政公署清河专员公署。1949年3月山东省政府更名为山东省人民政府，博兴县政府更名为博兴县人民政府，仍属渤海行署。

中华人民共和国建立后，博兴县属惠民专员公署。1956年3月撤蒲台县，其地域并入博兴县。1958年撤桓台县、齐东县，其大部地域并入博兴县。同时，撤惠民地区，博兴县改属淄博专员公署。1961年复置惠民地区，博兴县改属惠民地区专员公署。1978年惠民专员公署更名惠民行政公署，博兴县仍属之。1992年3月惠民地区行政公署改为滨州地区行政公署，博兴县仍属之。2000年6月，滨州地区行政公署改为滨州市，博兴属之。清河专署。