肇州一共有两个中学，一个是肇州一中，另一个是肇州三中。

肇州县第一中学（肇州一中），即我国黑龙江省大庆市肇州县第一中学，是肇州县重点中学之一。成立于1944年，是大庆市建校历史最长的一所中学。1959年分为一、二中。肇州县第一中学拥有较为雄厚的实力，有初中4个年组 。学校自成立以来为肇州教育事业做出巨大贡献，培养无数精英人才。肇州一中有一支勤劳工作、无私奉献、品德高尚、学识渊博的教师团队，其中包括大量国家级、省级、市级、县级重点教师，还有一群认真学习、求异创新、热情奔放、自由自在的学生群体。肇州一中凭借自己努力踏实的工作，获得了全县人民的一致赞誉。现如今，一中人正在以高昂的工作热情、学习态度来面对新的挑战，高喊着“一中的荣誉高于一切”的口号，来实现肇州一中新的突破，迎接更加美好的未来。

肇州县第三中学是一所市直完全中学。现有校园面积34亩。北依南岳之首的回雁峰，南傍绿 草如茵的古樟园，东临浩荡北去的湘江，与肇州八景之一的东州岛隔江相望，环境恬静优美，四季花繁草绿，景色宜人，是读书、治学、成才的理想场所。