民国27年（1938年）
1月，赣粤边游击队在江西省大余县池江集结，改编为新四军第一支队，3月北上抗日。
2月24日，日机12架突袭南雄城，投弹廿余枚。驻雄中央空军二十大队起飞迎击，飞行员陈其伟在空战中中弹牺牲，飞机坠毁于迳口，县城军民隆重集会追悼。
6月16日，日军木更津航空第二队，重整残机6架由台北起飞，挂满炸弹，直向中国大陆进犯，以粤北韶关乐昌车站为目标，中国空军由黄泮扬大队长率机前往拦截，在南雄、仁化上空发生猛烈遭遇战，黄大队长击落1架，命中敌机所带之炸弹，敌机连人带机化成粉碎，无一人生还。此战共击落日机5架，史称“六一六”南雄空战。
8月30日上午10时，日机17架袭击南雄机场，驻雄中央空军飞机9架起飞还击，空战30分钟，击落日机6架，大队长吴汝鎏座机中弹起火坠毁，吴汝鎏壮烈牺牲，南雄军民隆重举行追悼会，南雄机场命名为“汝鎏机场”。
秋，广东青年抗日先锋队南雄县队成立，中共党员董天锡任队长，各中小学成立抗日同志会，广泛开展抗日宣传活动。
12月5日，日机两批16架次突袭南雄城，投弹100余枚，燃烧弹两枚，炸死20多人，重伤16人，轻伤60余人，房屋倒塌40余间。
是年，南雄县政府向省政府呈报，日机来袭13次，共163架次，炸死70人，伤71人，毁屋158间。

民国28年（1939年）
春，中共广东省委书记张文彬来南雄传达六届六中全会精神，成立南雄中心县委，书记罗世珍。
6月23日下午1时50分，日机8架袭击南雄城，投弹30余枚，毁民房29间，炸死19人，伤17人。
8月，中共广东省委机关由江西省信丰县九渡水迁来南雄瑶坑村。
冬，中共广东省委在全安乡里岗岭炮楼举办县级党员训练班，有30多人，翌年5月结束。
是年，国民政府第四战区在南雄修仁仓边村举办党政军训练团，训练县团级干部，每期3个月。

民国29年（1940年）
7月，广东省政府在南雄修仁仓边村举办广东省地方行政干部训练团，集训16个县行政干部（县府科长、部分中小学校长等），每期3个月。
是年，国民政府发行战时公债，全县配额法币52万元，实收37．94万元。

民国30年（1941年）
1月，省政府利用南雄机场开辟香港至南雄班机航线，每晚起飞降落10架次以上，1941年12月香港被日寇侵占，航线封闭。

6月，县政府在修仁村省行政干训团址，举办地方干部训练所，分期分批轮训乡基层干部。
9月，国民党顽固派突袭中共南雄中心县委驻地古坑。幸早有察觉，已作应变转移。从此，中共南雄县委改委员制为特派员制，以利隐蔽活动。
11月26日，日机轰炸南雄城，毁民房26间，炸死39人，伤36人。
是年，陆续迁来南雄的国民党中央及省属军政机关达50个，电台7部。较重要的机关单位有军政部第二十三补训处，军政部第八十五陆军医院，财政部粤东盐务管理局（在午田），广东绥靖公署陆军总医院（在灵潭）、广东省儿童教养院第六分院（在修仁）。

民国31年（1942年）
12月，县政府为增加战时生产，救济失业贫民，从广东新生活运动会妇女工作生产团购回纺纱机30架，开办南雄县纺纱厂。
广东省政府战时通讯所无线电台南雄分台（1940年5月设）撤销，成立南雄县政府无线电台。
县政府奉命筹募同盟胜利公债，全年配额国币170万元，美金8．7万元，实募国币154万元，美金1.7万元。

民国32年（1943年）
4月，县政府再次奉命筹募同盟胜利公债，全县完成配额国币568．6万元。

民国33年（1944年）
秋，县政府奉令成立南雄县抗日自卫总队，区成立大队，乡成立中队。1945年4月，缩编为南雄县后备队指挥所预编后备队，其中第十二中队在中共地下党掌握下，积极开展抗日斗争。
是年冬，因日本侵略军迫近南雄，南雄中学东迁河源县（今河源市），1946年春迁回南雄。

民国34年（1945年）
2月，日本侵略军进逼南雄，南始曲守备司令李震下令烧毁飞机场仓库，炸毁河南桥。3日下午4时，日军围攻南雄城，6时城陷，县政府撤至宝江乡长潭尾村（3月迁至龙口圩），并在百顺成立办事处。
6月5日，驻县城日本侵略军分两路进犯，一路沿雄信公路前进，7日陷湖口，8日占长甫桥、黄坑圩，曾一度进扰新田，遭国民革命军阻击，退回黄坑。另一路走乡道，7日陷水口，8日占弱过，主力由水口经江头、南甫入江西龙南。月底，驻大余县和黄坑圩日本侵略军均退入南雄城。
7月12日，县地方武装配合国军一八七师五六团，向盘踞南雄的日本侵略军反攻。
23日深夜，日军向始兴撤退，国民革命军收复南雄县城。
8月14日，日皇宣布无条件投降。
是月，成立南雄县善后委员会，调查南雄县沦陷后损失情况。县政府报告称：全县被日军盘踞2镇7乡，被蹂躏12个乡、23个村，被抢夺粮食20万石（1万吨），房屋被毁7000间，死亡5800人，失踪200人，流亡3500人。
王震、王首道根据中共中央建立五岭根据地指示，率部南下，于8月27日到达南雄北山上石多，旋因日本投降，时局变化，接军委电报后轻装北上。
9月中旬，中共广东区委根据中共中央建立五岭根据地指示组成的粤北指挥部和粤北党政军委员会，到达南雄北山，得悉王震部已北上，即将部队就地展开游击，并成立中共五岭工委。
是月，一八七师师长张光琼以汉奸罪枪决伪复兴委员会秘书冯肇甄。