平原县辖7个镇、3个乡、2个街道办事处、1个经济开发区：王凤楼镇、前曹镇、恩城镇、王庙镇、王杲铺镇、张华镇、腰站镇、坊子乡，王打卦乡、三唐乡、龙门街道办事处、桃园街道办事处、龙门经济开发区。　　1992年10月4日，将平原县的王村店乡划归德州市管辖。

　　1996年5月3日，撤销平原县王杲铺乡，设立王杲铺镇（鲁政函民字【1996】20号）。

　　1998年7月28日，撤销平原县张华乡，设立张华镇（鲁政函民字【1998】18号）。

　　1999年，平原县辖6个镇、12个乡：平原镇、恩城镇、王风楼镇、腰站镇、王杲铺镇、张华镇、芦坊乡、王大卦乡、三唐乡、坊子乡、张士府乡、前曹乡、尹屯乡、寇坊乡、林庄乡、王庙乡、苏集乡。

　　2000年6月15日，平原县撤销寇家坊乡、炉坊乡，将其行政区域并入平原镇；撤销张士府乡，将其行政区域并入王凤楼镇；撤销前曹乡、尹屯乡、林庄乡，合并设立前曹镇，前曹镇人民政府驻原前曹乡人民政府驻地；撤销十里铺乡，将其行政区域并入恩城镇；撤销王庙乡、苏集乡，合并设立王庙镇，王庙镇人民政府驻原王庙乡人民政府驻地。

　　2000年，平原县辖8个镇、3个乡。总人口439701人，各乡镇人口：平原镇96800、王风楼镇 51206、前曹镇 52459、恩城镇 56244、王庙镇34489、王杲铺镇31177、张华镇21615、腰站镇24302、坊子乡 27692、王打卦乡 23669、三唐乡 20048。 （根据第五次人口普查数据；单位：人）

　　2010年，撤销平原县王打卦乡，设立王打卦镇。

　　目前，平原县城区已经设立桃园街道办事处和龙门街道办事处。

　　截至2011年3月31日，平原县辖2个街道办事处，8个镇、2个乡，一个省级经济开发区。