梅花山原是三国吴大帝孙权的葬地。孙权18岁掌握东吴政权后，为对付曹魏，他听取了诸葛瑾等人建都秣陵的建议，并改秣陵为建业。孙权对古代南京城市的发展贡献很大，他大大拓建了南京城，从当时建业的规模来看，“东凭钟山，北倚后湖(玄武湖)，南近秦淮，西临石头。”孙权还疏浚和拓宽了秦淮河，开凿了青溪、运渎和破岗渎等运河，同秦淮河沟通在一起，解决了南京的排水和用水问题。根据文献记载，孙权死后葬在朝阳门外第三个山岗，这个山岗因而被称为孙陵岗。孙陵岗葬有孙权和他的夫人步氏及后妻潘夫人，太子孙登也葬在孙陵附近。
相传朱元璋修建地宫时，主持建陵工程的中军都督府佥事李新奉命把附近所有建筑迁往别处，孙陵也在这一范围内。李新为慎重起见，就迁移孙陵的问题专门请示明太祖朱元璋。朱元璋说，孙权是一位好汉，把他的墓留下来，给我看大门吧。这样，孙陵得到完整保存。