1368年（明洪武元年），改汀州路为汀州府，1369年（明洪武二年），置福建行中书省，长汀县属福建行中书省。1376年（明洪武九年），改行中书省为承宣布政使司，长汀县属福建承宣布政使司。清代沿用明代制度。长汀县始终为汀州、郡、路、府属县。
1913年（民国二年），废府建置，长汀县属汀漳道，隶福建省。1919年八年（民国八年），闽军与护法军协议，长汀县属护法区。公元1925年（民国十四年），复隶福建省。
1929年3月，红军入长汀，建长汀县革命委员会，为闽西、赣南第一个红色县级政权，苏维埃政府于涂坊，属闽西苏维埃政府。1931年10月，建立汀州市苏维埃政府于城关。12月，以南阳、才溪、通贤、畲心、涂坊、中屋村、水口、三洲、濯田等区建新汀县，县治设于濯田。以河田、四都、古城、长汀附城、汀东、童坊、张地等地为长汀县，县治设于河田。市、县均属西苏维埃政府。1932年3月，建立福建省苏维埃政府于汀州市；与此同时，撤销新汀县。才溪、通贤划归上杭县，南阳划归新泉县，其余各区并长汀县。10月，分长汀县东北部分地建立汀东县于馆前；1933年9月，分长汀县近汀州市部分地区建立兆征县，县治设省苏维埃政府内，均属福建省苏维埃政府。