治理地方

686年（垂拱二年），狄仁杰出任宁州刺史，在任内妥善处理民族关系，深受拥戴，宁州百姓还为他立碑颂扬。当时，右台监察御史郭翰巡察陇右诸州县，弹劾了大批官员。到达宁州后，见颂扬刺史美德的人不绝于路，郭翰对人说：“一到州境内，就知道治理的如何了。”于是向朝廷推荐狄仁杰。不久，狄仁杰被征拜为冬官侍郎。[7] 狄仁杰

688年（垂拱四年），狄仁杰充任江南巡抚使。当时，江南之地有很多民间自行设立的祠庙，狄仁杰奏请焚毁1700余所，只留下夏禹、吴太伯、季札、伍员四祠。不久，狄仁杰改任文昌右丞，又出为豫州刺史。[8]

当时，越王李贞在豫州起兵反抗武则天失败，六七百人受到株连，五千余人没入官籍。司刑使逼狄仁杰行刑，狄仁杰认为判决有误，请求延缓行刑，然后秘奏武则天道：“我本想正大光明的上奏，但似乎有谋逆的人说清之嫌；但是如果我明白什么是对的又不说的话，恐怕违背了陛下您怜悯天下百姓之心。这些人做出谋逆之事并非他们自愿，希望您怜悯他们的不得已。”武则天就下旨赦免了她们的死罪，改为发配到丰州。囚犯们被押至宁州时，宁州父老到郊外迎接，并道：“是我们的狄使君救了你们的命吧？”于是囚犯们相互搀扶着到百姓为狄仁杰立的石碑旁哭成一片，斋戒三日，这才离开宁州。囚犯们到丰州后，又为狄仁杰立碑，以颂恩德。[9]

当时，宰相张光辅率军讨平李贞之乱，部下将士自恃功劳，大肆勒索，狄仁杰一概不予听从。张光辅怒道：“你这州官是要怠慢元帅吗？”狄仁杰说：“祸乱河南的只是一个李贞而已。现在一个李贞死了，而千万个李贞又生了。”张光辅不解其意，狄仁杰道：“您率领三十万军队平定叛乱，但是不能约束士兵，纵容他们的暴行，那些无辜百姓死亡惨重，不忍目睹，这不是一个越王死了而千万个越王又生了吗？况且，那些遭胁迫跟随越王的人，他们势必不愿坚守，等到朝廷军队突然攻来之后，放弃城池归顺朝廷的不可胜数，那些归顺的人顺着绳子从城墙上滑下，城池四周踏出一条条的小路，你为什么纵容那些贪求战功的人，去追杀这些准备归顺投降的人呢？只恐怕冤声沸腾直冲九霄云天！我如能请来尚方斩马剑，就杀了你这罪人，到时我再向朝廷请罪，即使我死了，我的功德也将永远铭记在百姓的心中。”张光辅无言以对，但是却怀恨在心，回朝后便弹劾狄仁杰出言不逊。狄仁杰被贬为复州（今湖北沔阳西南）刺史，后出任洛州司马。[10]