明洪武二十年（1387），明太祖朱元璋为抗御倭寇侵扰，命信国公汤和在金舟乡置卫筑城，改称金乡卫。清顺治十八年（1661），朝廷实行“禁海迁界”政策，金乡蒲门一带居民内迁十里，扦木为界，界外沿海房屋全部烧毁，居民一律从界外迁至界内。被迁之处，哀鸿遍野，渔盐之利尽失。康熙九年（1670），朝廷下令“展界”，恢复金乡等界外地，并称金乡卫为“金乡寨”。后至清道光年间，有李庚的“金镇图记”。可见在清代时，并无“金乡镇”的名称。

民国时，始有“金乡镇”之称谓，一直延续至中华人民共和国成立后基本不变。1981年，“平阳县”析县，新建“苍南县”，金乡镇隶属“苍南县”。

金乡镇自北至东至南至西依次有巴艚、炎亭、石坪、大渔、小渔诸多渔港。鳗苗、对虾、鲥鱼、蝤蛑、黄花鱼、梭子蟹等，应有尽有，以至于最名贵的黄唇鱼（俗称黄干）也时有在菜市场出现（现在已极罕见）。海涂还有蛏子、花蛤、跳鱼、岩奶、黄泥螺等鲜活味美的海产品。“涂头跳鱼烧菜干”“清水蝤蛑爬菜篮”等顺口民言，是海产品丰盛的真实写照。