国清寺内有三尊大佛，释迦牟尼、西方极乐世界的阿弥陀佛、东方琉璃世界的琉璃光佛。

在国清大殿中释家牟尼居中，右尊为西方极乐世界的阿弥陀佛，左尊为东方琉璃世界的琉璃光佛。药师佛救死扶伤，阿弥陀佛接引众生，与其它寺院中释家牟尼两侧侍者是阿难和迦叶有所不同。国清寺最珍贵的当属念佛堂供奉的白玉千手观音。这尊缅甸国赠送的玉观音由一块整体的缅甸玉石雕刻而成，玉质细腻，高三点八米，重四吨。这样造型的玉观音在全国也是罕见的。睡下来的释家牟尼佛、卧佛那种玉佛很多，象国清寺这种千手观音玉佛，是唯独少见的，可以说在全国国清寺是第一尊。
　　古寺还是中日友好的见证。唐开成年间，日本高僧圆仁随第13批遣唐使西渡求法，来到掘港国清寺，住宿寺内半月有余。圆仁后来所写的《入唐求法巡礼行记》中，对掘港国清寺有详细记述。在世界旅游文化宝库里，圆仁的《入唐求法巡礼行记》，与我国唐玄奘的《大唐西域记》、意大利旅行家马可.波罗的《东方见闻录》被列为"世界三大旅行游记"。《行记》的面世使"掘港"、如东"国清寺"在历史典籍中首次亮相，也成为中日文化交流的一段佳话。