石窟风化治理规划实施阶段（1990年～2005年）
从1992年起，拉开了“云冈石窟风化治理工程”（“八五”维修工程）的序幕。5年中先后完成的项目有：
降低窟前地面，考古发掘，修建排水渠道，增设安全监控、输电线路，硬化地面，
修建保护性窟檐，包括恢复第8窟窟檐、设计第9、10、19窟窟檐；
保护性围墙：崖顶修建保护性围墙、旧围墙翻修扩建；
洞窟保护维修加固工程；
窟顶防渗排水试验研究工程；
制定《云冈石窟规划》，编制《云冈石窟保护管理条例》。
其后，1998年109国道云冈段得以改线；2001年，云冈石窟申报列入《世界遗产名录》成功；2002年，云冈石窟防水保护工程全面启动。
石窟防水试验工程及第11窟维修等（2005年～2008年）
2005年以来云冈石窟主要进行了三项本体保护工程，分别为西部窟区防水试验工程、11窟维修加固工程及洞窟除尘。
云冈石窟景观（一）
云冈石窟景观（一）(20张)
西部窟区防水试验工程：2007年初，研究院详细调查了云冈西部窟区的地理环境和石窟现状，经过缜密的设计，做出最终的试验方案，并于4月份全面启动。该工程分两部分：一是进行顶部护坡的防渗处理；二是进行前立壁的加固。[6]
11窟维修加固工程：2007年，首先着手于对第11窟进行抢救性保护维修。针对11窟北壁岩石成片状大面积脱落和泥塑壁画残块、剥离、空鼓、起甲、昆虫动物污染等病害，进行全面加固与修复。
洞窟除尘：云冈石窟研究院于2009年对第5-13窟进行了除尘。具体方法是用软羊毛刷除掉石雕身上的沉积物，同时用A4纸收集承接这些沉积物，这样做既可以避免除尘过程中对文物本体的损害，又可以防止二次扬尘。此次工程历时一个月。[6]