清自顺治三年（1646）起沿袭明制。

民国元年（1912）仍称建宁府，后改称建瓯府，民国2年裁府，合并建安、瓯宁2县，各

取首字命名为建瓯县，属建安道管辖，道址设在南平。民国17年，废除道，只设省、县两级，建瓯改为县政府，直属省管辖。民国35年，全省划分为7个行政督察工，建瓯属第三行政督察区。行政督察专员公署设在建阳。

1949年5月13日，建瓯解放，设福建省第一行政督察专员公署，管辖建瓯、建阳、崇安、浦城、水吉、松溪、政和、邵武、光泽9县，专员公署设在建瓯。

1950年3月，改为建瓯行政专员公署。同年4月，署址移设建阳，改名为建阳行政专员公署。建瓯县属建阳行政专员公署。

1956年，建阳专员公署并入南平专员公署，建瓯县改属南平专员公署管辖。

1970年复设建阳地区行政公署，建瓯县属建阳地区行署管辖。

1989年1月，建阳地区行政公署改名为南平地区行政公署，管辖南平、顺昌、建瓯、建阳、崇安、浦城、松溪、政和、邵武、光泽10个县市。