东山中学前身是同安六中、厦门市文教职业学校。创办于1960年，1965年开办普高，1981年改办职高，2000 年10 月，经福建省教育厅批准复办普通高中（闽教[2000]中74号文），有着四十多年来厚实的历史积淀和办学传统。2000年，学校试办职业高中。2001年，创办厦门女子职业学校。2003年，女子职业学校分离出去。近十年来，学校实现了超常规、跨越式发展，办学效益得到了社会的广泛赞誉，2003年被省教委直接定为省二级达标学校，3月年成为全省26所一级达标学校之一，步入名校行列。2003年，在厦门市新一轮教育改革中率先实施与东渡中学合并，实行高初中分设办学，学校分厦禾、东渡两校区，厦禾校区为初中部，东渡校区为高中部；合并后即扩建高中部，扩大优质教育资源。在厦门市第一所正式申报示范性高中，并于2004年以较高分数通过市级验收。加强同世界教育的交流与合作，积极探索合作办学新路子。