自鲁昭公元年（前541年）至鲁哀公二十七年（前468年）为莒国历史的末期。这一时期，晋国公室逐渐强大，国力内耗不复外顾，莒失去了援助。莒君在历史上有记载者，有公子展舆、著邱公、共公、郊公等四人。嗣后入战国，莒事无记载。到了公元前431年，楚国灭莒。
在这段时间内，莒国的国土经常被齐国、鲁国占领，国势渐渐变得虚弱，只好采取守势。而且，莒国有内乱，展舆当国君后，夺走了「群公子」秩的权利，群公子怀恨在心，把公子去疾从齐国召回，立为莒国君主。展舆在吴国避难，他的党羽务娄等三人奔赴齐国，带走了「大庞」、「常仪靡」二邑。后来，「牟夷」又去鲁国，把「牟娄」及「防」二邑送给鲁国。
前532年，鲁国伐莒，攻占了「郠」。「郠」位于今沂水县边界，也是莒国的门户，因此，莒国西疆撤走了所有防守部队。在这时，莒仍然内乱不止。国君去疾死后，蒲余侯杀公子意恢，从齐国迎回了公子去疾之弟公子庚舆成为国君，此后莒国成为齐国的附庸。
前523年，莒想摆脱齐国的控制，两次导致齐国的攻击，但此时，莒的国力大大缩退，比不上周围的国家。在战国时代，楚国的势力扩张到淮河上游，灭亡了蔡国，进而灭莒。但是，莒离楚国还是比较远，楚不能长期占有莒地，莒国的全境最终成为了齐国的疆土。